RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR18Q9BV38 432 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 M0R2C6 588 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 GPAA1O43292 621 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 TLR2O60603 784 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 GH2P01242 217 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 SHMT1P34896 483 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 C12orf60Q5U649 245 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 SP3Q02447 781 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 CTR9Q6PD62 1173 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 GNAT2P19087 354 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 CABP5Q9NP86 173 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 APPP05067 770 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 SWAP70Q9UH65 585 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.31■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 FOCADQ5VW36 1801 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM22K7EJ46 135 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 HMGCS2P54868 508 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 BACE1P56817 501 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 RILPL2Q969X0 211 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 ERO1AQ96HE7 468 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 ABHD8Q96I13 439 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 SIPA1L1O43166 1804 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 C19orf81C9J6K1 198 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L10C9JJH3 530 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP2C8P10632 490 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 SBK1Q52WX2 424 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 C17orf99Q6UX52 265 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 LAMB1P07942 1786 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK8P49336 464 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 MTMR2Q13614 643 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 TREML2Q5T2D2 321 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 TICAM2Q86XR7 235 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 CPA4Q9UI42 421 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH1P12882 1939 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP4-204ENST00000416021 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 CAPN15O75808 1086 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 PDE4AP27815 886 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 GUCY1A2P33402 732 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM17Q9Y577 477 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 DOCK1Q14185 1865 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 TDO2P48775 406 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 SEPT2Q15019 361 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 CAP1Q01518 475 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC17Q96LX7 622 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM227BQ96M60 508 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 EFCC1Q9HA90 598 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 EMILIN3Q9NT22 766 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 ADGRA2Q96PE1 1338 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 AKR1B1P15121 316 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 OSBPP22059 807 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 ARHGEF6Q15052 776 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 ACER1Q8TDN7 264 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 PNMA3Q9UL41 463 aa25.23■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 SDSP20132 328 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 KIF22Q14807 665 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 BCRP11274 1271 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SH3BP4-204ENST00000416021 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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