RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 ALX1Q15699 326 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPRYD7Q5W111 196 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 CREB3L3Q68CJ9 461 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 CERS5Q8N5B7 392 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM227BQ96M60 508 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 F8W031 263 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 IDH1O75874 414 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 IREB2P48200 963 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 GIMAP6Q6P9H5 292 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZDHHC9Q9Y397 364 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIF3AQ9Y496 699 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNX14Q9Y5W7 946 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 MYH7P12883 1935 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 WDR19Q8NEZ3 1342 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 AKAP11Q9UKA4 1901 aa11.65□□□□□ -0.54
APOBEC3G-201ENST00000407997 BRD1O95696 1058 aa11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRDNQ13061 729 aa11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 RASGRF1Q13972 1273 aa11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRKG1Q13976 671 aa11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 MFSD14BQ5SR56 506 aa11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 RUFY3Q7L099 469 aa11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 MTA3Q9BTC8 594 aa11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 VEZTQ9HBM0 779 aa11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa11.65□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPR25O00155 361 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNAP23O00161 211 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC27A2O14975 620 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 FKTNO75072 461 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 TBC1D8O95759 1140 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 PDE6AP16499 860 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 TNNI2P48788 182 aa11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 BCAMP50895 628 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 CUL4AQ13619 759 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 SYCP1Q15431 976 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 FBXL16Q8N461 479 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 NEK1Q96PY6 1258 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 CNNM2Q9H8M5 875 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAST3O60307 1309 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLRN2A0PK11 232 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF213O14771 459 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPAA1O43292 621 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 BAG3O95817 575 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLCG2P16885 1265 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 PTH1RQ03431 593 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 RASA3Q14644 834 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 FEZ1Q99689 392 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 PDRG1Q9NUG6 133 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 HPS5Q9UPZ3 1129 aa11.63□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A1B0GUL6 1792 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 CASTP20810 708 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 GYG1P46976 350 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 IFNL1Q8IU54 200 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 AMOTL1Q8IY63 956 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 HOOK2Q96ED9 719 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 WNK4Q96J92 1243 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 DOCK2Q92608 1830 aa11.62□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 PKP1Q13835 747 aa11.61□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 OSBP2Q969R2 916 aa11.61□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 MRIQ9BWK5 157 aa11.61□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAI14Q9P0K7 980 aa11.61□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 JAG2Q9Y219 1238 aa11.61□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 RPS6KB1P23443 525 aa11.6□□□□□ -0.55
APOBEC3G-201ENST00000407997 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms