RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 BIRC3Q13489 604 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 GGT6Q6P531 493 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC39A13Q96H72 371 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 COL6A1P12109 1028 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC16A2P36021 539 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 ERMNQ8TAM6 284 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 SPTLC3Q9NUV7 552 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 WDR66Q8TBY9 1149 aa7.73□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 TEX35Q5T0J7 233 aa7.73□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 PSD3Q9NYI0 1048 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.72□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.71□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 TRPC6Q9Y210 931 aa7.71□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.17
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.71□□□□□ -1.17
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RABGEF1-202ENST00000380828 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.71□□□□□ -1.18
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