RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 DDB1Q16531 1140 aa20.59■□□□□ 0.89
PKP3-201ENST00000331563 ATRIPQ8WXE1 791 aa20.59■□□□□ 0.89
PKP3-201ENST00000331563 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PKP3-201ENST00000331563 A0A0G2JLW4 131 aa20.58■□□□□ 0.89
PKP3-201ENST00000331563 ATP5JP18859 108 aa20.58■□□□□ 0.89
PKP3-201ENST00000331563 EIF5P55010 431 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PKP3-201ENST00000331563 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
PKP3-201ENST00000331563 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PKP3-201ENST00000331563 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.58■□□□□ 0.89
PKP3-201ENST00000331563 MYH15Q9Y2K3 1946 aa20.58■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.58■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 MYO1BO43795 1136 aa20.58■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 USP8P40818 1118 aa20.58■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 PDE4BQ07343 736 aa20.58■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 TCIRG1Q13488 830 aa20.58■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 PPP2R5AQ15172 486 aa20.58■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 FAM107BQ9H098 131 aa20.57■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 KIF28PB7ZC32 967 aa20.57■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 KCNQ2O43526 872 aa20.57■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 TUBB4BP68371 445 aa20.57■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 CCDC102BQ68D86 513 aa20.57■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.57■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 PHLPP1O60346 1717 aa20.57■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 DISP2A7MBM2 1401 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 CLIC6Q96NY7 704 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 ADGRG1Q9Y653 693 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 LAMB4A4D0S4 1761 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 CDC27P30260 824 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 SLC39A14Q15043 492 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 SLC35F6Q8N357 371 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 JMYQ8N9B5 988 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 KAT2BQ92831 832 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 ITGB4P16144 1822 aa20.56■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 BCL9O00512 1426 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 TOM1O60784 492 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 LONRF3Q496Y0 759 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 SHC4Q6S5L8 630 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 SMIM5Q71RC9 77 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 C8orf37Q96NL8 207 aa20.55■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 CCT5P48643 541 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 FAM182BQ5T319 152 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 TUBB2AQ13885 445 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.54■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 ZNF827Q17R98 1081 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 CCDC148Q8NFR7 591 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 EBAG9O00559 213 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 IRF6O14896 467 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 FOXN1O15353 648 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 IGSF22Q8N9C0 903 aa20.53■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 TUBBP07437 444 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 KCNH3Q9ULD8 1083 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 BMP6P22004 513 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 SCP2P22307 547 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.884e-7■■■■□ 22.1
PKP3-201ENST00000331563 MAP9Q49MG5 647 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 SPECC1Q5M775 1068 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 PTF1AQ7RTS3 328 aa20.52■□□□□ 0.88
PKP3-201ENST00000331563 HAND2P61296 217 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 RBL2Q08999 1139 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 PANX2Q96RD6 677 aa20.51■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PKP3-201ENST00000331563 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.2 ms