RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267328.4

RAB20-201, Transcript of RAB20, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB20, Length 1,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20-201ENST00000267328 NEDD4P46934 1319 aa28.01■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 E7EWF7 191 aa28■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 CAP2P40123 477 aa28■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 STOX1Q6ZVD7 989 aa28■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa27.99■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 CNNM2Q9H8M5 875 aa27.99■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 GINM1Q9NU53 330 aa27.99■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 TMEM88BA6NKF7 163 aa27.98■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 SNX14Q9Y5W7 946 aa27.98■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 GDF11O95390 407 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 AKR1B1P15121 316 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 SCYL3Q8IZE3 742 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP27.97■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 KRT23Q9C075 422 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 PLIN4Q96Q06 1357 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 VGLL4Q14135 290 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 KRT32Q14532 448 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 TOMM22Q9NS69 142 aa27.97■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 APLP1P51693 650 aa27.96■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 JAG1P78504 1218 aa27.96■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 TRDNQ13061 729 aa27.96■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 NCOA7Q8NI08 942 aa27.96■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 ESR2Q92731 530 aa27.96■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa27.96■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 CSADQ9Y600 493 aa27.96■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 TLL2Q9Y6L7 1015 aa27.96■■■□□ 2.07
RAB20-201ENST00000267328 B4E1Z4 1266 aa27.95■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 ASNSP08243 561 aa27.95■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 SAPCD2Q86UD0 394 aa27.95■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 NKX2-3Q8TAU0 364 aa27.95■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 CABP5Q9NP86 173 aa27.95■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa27.95■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 GH2P01242 217 aa27.94■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 ANAPC15P60006 121 aa27.94■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 TFAP4Q01664 338 aa27.94■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 FAM47AQ5JRC9 791 aa27.94■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 TMEM179Q6ZVK1 233 aa27.94■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 NEDD1Q8NHV4 660 aa27.94■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 TSPY2A6NKD2 308 aa27.93■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 TSPY3P0CV98 308 aa27.93■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 TSPY8P0CW00 308 aa27.93■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 HUNKP57058 714 aa27.93■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 IL17RAQ96F46 866 aa27.93■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 CLMNQ96JQ2 1002 aa27.93■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 PHIPQ8WWQ0 1821 aa27.93■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 GUCY1A2P33402 732 aa27.92■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 ADCK5Q3MIX3 580 aa27.92■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.92■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 CREBZFQ9NS37 354 aa27.92■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 KDM4AO75164 1064 aa27.92■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 NEK1Q96PY6 1258 aa27.92■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 PICK1Q9NRD5 415 aa27.92■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 ZSWIM5Q9P217 1185 aa27.92■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.91■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 HHIPL1Q96JK4 782 aa27.91■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 PTPRAP18433 802 aa27.9■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 SEPT2Q15019 361 aa27.9■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 ELP3Q9H9T3 547 aa27.9■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa27.9■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.89■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 ERO1BQ86YB8 467 aa27.89■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
RAB20-201ENST00000267328 SPDYE5A6NIY4 337 aa27.88■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 USP17L5A8MUK1 530 aa27.88■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 RAB3GAP1Q15042 981 aa27.88■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 SLC10A4Q96EP9 437 aa27.88■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.88■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 TM6SF1Q9BZW5 370 aa27.88■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 KANSL2Q9H9L4 492 aa27.88■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 IL17RBQ9NRM6 502 aa27.88■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 PSMA5P28066 241 aa27.87■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 C1QTNF8P60827 252 aa27.87■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.87■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 MCM5P33992 734 aa27.87■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 NOVP48745 357 aa27.87■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 ANTXR2P58335 489 aa27.87■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 PPATQ06203 517 aa27.87■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 RGMBQ6NW40 437 aa27.87■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 IQCA1Q86XH1 822 aa27.87■■■□□ 2.05
RAB20-201ENST00000267328 CEP95Q96GE4 821 aa27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 921.3 ms