RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233027.9

NEK4-201, Transcript of NIMA related kinase 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK4, Length 6,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK4-201ENST00000233027 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NEK4-201ENST00000233027 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NEK4-201ENST00000233027 MAGEA1P43355 309 aa14.9□□□□□ -0.02
NEK4-201ENST00000233027 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.9□□□□□ -0.02
NEK4-201ENST00000233027 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
NEK4-201ENST00000233027 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
NEK4-201ENST00000233027 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.9□□□□□ -0.02
NEK4-201ENST00000233027 CABP7Q86V35 215 aa14.9□□□□□ -0.02
NEK4-201ENST00000233027 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.9□□□□□ -0.02
NEK4-201ENST00000233027 USTQ9Y2C2 406 aa14.9□□□□□ -0.02
NEK4-201ENST00000233027 MAP3K9P80192 1104 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 CETN3O15182 167 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 UFL1O94874 794 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 PFKFB1P16118 471 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 TTC6Q86TZ1 520 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 E7EVH7 732 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 KIAA1524Q8TCG1 905 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 ALDH3A1P30838 453 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 ZNF131P52739 623 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 PPFIBP2Q8ND30 876 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 PDE8AO60658 829 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 FYB2Q5VWT5 728 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.89□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 USH1GQ495M9 461 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 HAUS3Q68CZ6 603 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 ZNF365Q70YC5 407 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 SPATA5Q8NB90 893 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 CALCRLQ16602 461 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 RRAGAQ7L523 313 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 IFT74Q96LB3 600 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 ASIC3Q9UHC3 531 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 A0A0D9SFI3 127 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 GNPATO15228 680 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 GCKRQ14397 625 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 MYO1AQ9UBC5 1043 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 SBNO1A3KN83 1393 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 PCK1P35558 622 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 GUCY2FP51841 1108 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 PTPROQ16827 1216 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 MGARPQ8TDB4 240 aa14.88□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 GCNT3O95395 438 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 HSPA1LP34931 641 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 ADCY7P51828 1080 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 POTEDQ86YR6 584 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 STX10O60499 249 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 RNF123Q5XPI4 1314 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 PAK2Q13177 524 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 MYCT1Q8N699 235 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 KIFC2Q96AC6 838 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 USP28Q96RU2 1077 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 CSRNP2Q9H175 543 aa14.87□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 CCDC14Q49A88 953 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 C2CD5Q86YS7 1000 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 NEDD9Q14511 834 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 ZNF827Q17R98 1081 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 KIAA1468Q9P260 1216 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 WDR62O43379 1518 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 RPS6KA1Q15418 735 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 CLUL1Q15846 466 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 KCNA6P17658 529 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 SMTNP53814 917 aa14.86□□□□□ -0.03
NEK4-201ENST00000233027 LIN9Q5TKA1 542 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms