RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pou2af1Q64693 256 aa8.18□□□□□ -1.1
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnah7aE9Q0T8 4024 aa8.18□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prr15lQ8JZM2 100 aa8.17□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav14-1A0A0G2JF94 121 aa8.16□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P06320 134 aa8.16□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vpreb1P13372 142 aa8.16□□□□□ -1.1
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10837Q3UTT8 145 aa8.06□□□□□ -1.12
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr1aQ62266 144 aa8.06□□□□□ -1.12
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl55Q9CZ83 127 aa8.05□□□□□ -1.12
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv3-4A0A140T8Q4 119 aa7.99□□□□□ -1.13
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stard9Q80TF6 4561 aa7.93□□□□□ -1.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps13dB1ART2 4390 aa7.92□□□□□ -1.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Reg3aO09037 175 aa7.91□□□□□ -1.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phf5aP83870 110 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spint4Q9D263 159 aa7.9□□□□□ -1.14
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl37aP61514 92 aa7.89□□□□□ -1.15
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700074P13RikQ9D9G7 251 aa7.83□□□□□ -1.16
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10065F6TJM2 114 aa7.75□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10267M0QWD8 85 aa7.75□□□□□ -1.17
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