RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000198437.4

Dclk1-208, Transcript of Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Dclk1, Length 4,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Qrich2	A0A140LIY9	2337 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Wfdc17	Q5SSJ1	76 aa		5.01	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Abca2	P41234	2434 aa		5	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Trav9-2	A0A075B647	113 aa		5	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ndufb1	P0DN34	57 aa		5	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm3443	F7CCV5	94 aa		5	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Cypt15	B1AXS0	87 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Lypd5	Q9D7Z7	256 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Unc79	Q0KK59	2596 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Itpr3	P70227	2670 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	BC067074	F6RXI4	2391 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	AY074887	Q8R5F9	132 aa		4.99	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Cmya5	Q70KF4	3739 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Mga	A2AWL7	3003 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Pla2g1b	Q9Z0Y2	146 aa		4.98	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Wnk1	P83741	2377 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Sslp1	Q3UN54	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igkv3-2	A0A075B5P0	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Lelp1	Q9DAE3	120 aa		4.97	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gpha2	Q925Q5	128 aa		4.96	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Zfhx4	Q9JJN2	3550 aa		4.96	□□□□□ -1.61
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Epg5	Q80TA9	2572 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	C130032M10Rik	Q8C888	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ndufs5	Q99LY9	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Usp9x	P70398	2559 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Wdfy4	E9Q2M9	3149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm9513	B3GLJ6	99 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Mrpl34	Q99N91	92 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Zzef1	Q5SSH7	2924 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igkv3-1	A0A075B5P1	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Spink1	P09036	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Cox7b2	Q9D2H1	82 aa		4.95	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm9195	A0A140LHT4	2805 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Sfta2	E9PXB6	77 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Cox6a2	P43023	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Flnb	Q80X90	2602 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Akap13	E9Q394	2776 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igkv3-4	A0A140T8Q4	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Spink4	O35679	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Tep1	P97499	2629 aa		4.94	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Limd2	Q8BGB5	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Cep192	E9Q4Y4	2514 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Trav13-2	A0A075B649	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Map1a	Q9QYR6	2776 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Defb42	Q8BVB5	75 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Leap2	Q91V13	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm12216	A0A1W2P827	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Sptssb	Q925E8	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igkv1-122	A0A140T8M9	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Defb12	Q8K4N3	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm12353	A2AGJ4	60 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Reg3d	Q9QUS9	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm7257	D3YX25	99 aa		4.9	□□□□□ -1.62
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Fbn2	Q61555	2907 aa		4.9	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437		A0A286YE49	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Bahcc1	Q3UHR0	2643 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Prp2	P05143	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igkv8-16	A0A0G2JDG9	121 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Chtf8	P0CG14	533 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Nop10	Q9CQS2	64 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Pla2g10	Q9QXX3	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Cic	Q924A2	2510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Csmd2	V9GX34	3611 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Flna	Q8BTM8	2647 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm20538	F6Z9R1	75 aa		4.87	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437		Q8BGJ3	129 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Uqcr11	Q9CPX8	56 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Zfp462	B1AWL2	2495 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm20661	K7N787	53 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	2010109I03Rik	Q9CQ11	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm17577	J3QNF7	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	1700012A03Rik	Q9DAF1	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Prrc2c	Q3TLH4	2846 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Vpreb3	D3Z6J4	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Prol1	E9PYQ4	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Defb37	Q7TMD2	62 aa		4.85	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Muc2	Q80Z19	2680 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Prlh	G3UWC3	86 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igkv3-9	A0A140T8P4	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Tomm7	Q9D173	55 aa		4.84	□□□□□ -1.63
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	1700074P13Rik	Q9D9G7	251 aa		4.84	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Wfdc12	Q9JHY3	85 aa		4.84	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Lrba	Q9ESE1	2856 aa		4.84	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Dsp	E9Q557	2883 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Lama5	Q61001	3718 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Zcchc13	Q9D548	170 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Nbea	Q9EPN1	2936 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Chchd10	Q7TNL9	138 aa		4.83	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igkv4-61	A0A0G2JH00	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm2310	J3QNJ2	377 aa		4.82	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	D730001G18Rik	A0A087WQU7	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Ighv8-13	A0A075B5Y0	101 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Igkv4-54	A0A0G2JES9	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Mtor	Q9JLN9	2549 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437		A0A286YCN5	57 aa		4.81	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Reln	Q60841	3461 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Hivep3	A2A884	2348 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Gm3250	E9Q1M3	230 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Prcd	Q00LT2	53 aa		4.8	□□□□□ -1.64
Dclk1-208	ENSMUST00000198437	Cdk2ap2	Q9CPY4	127 aa		4.8	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 73.3 ms