RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000122213.7

Pdcl2-202, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,049 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 CrygaP04345 174 aa3.39□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Egr2P08152 470 aa3.39□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Atp5g3P56384 141 aa3.39□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Bsph2Q0Q236 131 aa3.39□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Bsph1Q3UW26 133 aa3.39□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Pxt1Q8K459 51 aa3.39□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Rbm7Q9CQT2 265 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Ss18l2Q9D174 77 aa3.39□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Lypd5Q9D7Z7 256 aa3.39□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 OtorQ9JIE3 128 aa3.39□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Ighv2-6A0A075B6A7 116 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm4064A0A087WR82 380 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Vsig4F6TUL9 280 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 P03985 172 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Prm2P07978 107 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm21748Q3UE70 102 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 B9d2Q3UK10 175 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Q3UNZ8 350 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm9944Q8C559 102 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Ndufa3Q9CQ91 84 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1700012A03RikQ9DAF1 130 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Dpm2Q9Z324 84 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 PtprqP0C5E4 2300 aa3.38□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Fbn1Q61554 2873 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm17472A0A075B683 117 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Trav14-2A0A075B694 121 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Trav6n-6A0A075B6B2 114 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm21693J3QK27 380 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Lamtor3O88653 124 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 P06329 120 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Hist1h2bfP10853 126 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Shisal1Q0VBP7 198 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm10643Q3URG9 111 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm10604Q3V0X7 143 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Defa24Q5G865 93 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Hist1h2bbQ64475 126 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Hist1h2bkQ8CGP1 126 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Hist1h2bpQ8CGP2 126 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Leap2Q91V13 76 aa3.37□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 ApcQ61315 2845 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Ighv1-59A0A0A6YXE0 117 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm10130F6ZHM5 101 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm11027G8JL69 66 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 BatfO35284 125 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 P01791 123 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Rnase13Q5GAM7 153 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Polr2kQ63871 58 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Psors1c2Q80ZC9 134 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 AI854703Q8BIN3 203 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 IqcjQ8BPW0 110 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Spag11Q8K4N2 71 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Chac1Q8R3J5 223 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Zc2hc1bQ9D534 172 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Wfdc2Q9DAU7 174 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Plpp2Q9DAX2 276 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Snai3Q9QY31 287 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Cd164Q9R0L9 197 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Sec11aQ9R0P6 179 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm15294V9GXA7 121 aa3.36□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Igkv4-91A0A075B5L2 119 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm12057A0A087WR21 115 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 2310009B15RikA0A0A6YWI4 143 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm43218A0A0G2JGT0 114 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Fndc10A2A9Q0 223 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Spink4O35679 86 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 AngP21570 145 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Cd24P24807 76 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Q5BN45 167 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Fam19a2Q7TPG7 131 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm5868Q8BJG1 145 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Q9D131 166 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Higd1aQ9JLR9 95 aa3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Srrm2Q8BTI8 2703 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Trav12-3A0A075B648 115 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Ighv1-11A0A0A6YWI9 117 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Igkv8-34A0A0G2JDU0 121 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm6812B1AXU1 112 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm6793B2RXM2 351 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1500009C09RikD3YYW9 81 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm9242J3QNY1 357 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1700020N15RikL7MTX3 112 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Cox8bP48772 70 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 P84751 237 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Znf664Q4VA44 261 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Trav3-1Q5R1I8 114 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Vmo1Q5SXG7 201 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Il1f10Q8R459 152 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Fam213bQ9DB60 201 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Mrpl32Q9DCI9 187 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gnb1lQ9EQ15 326 aa3.34□□□□□ -1.87
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Tenm1Q9WTS4 2731 aa3.34□□□□□ -1.88
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa3.33□□□□□ -1.88
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Trdv2-1A0A0G2JGB9 116 aa3.33□□□□□ -1.88
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm16181B0V2H2 73 aa3.33□□□□□ -1.88
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Gm20458E9PXJ7 78 aa3.33□□□□□ -1.88
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Cypt14J3QPF7 87 aa3.33□□□□□ -1.88
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 NpyP57774 97 aa3.33□□□□□ -1.88
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Ube2d3P61079 147 aa3.33□□□□□ -1.88
Pdcl2-202ENSMUST00000122213 Ube2d2P62838 147 aa3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 62.8 ms