RNA–Protein interactions for RNA: tC(GCA)B

tC(GCA)B, Transcript of Cysteine tRNA (tRNA-Cys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tC(GCA)B, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tC(GCA)BtC(GCA)B OM45P16547 393 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B PSO2P30620 661 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B NTH1P32356 751 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B LHS1P36016 881 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B EMC3P36039 253 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B FTH1P38310 465 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B SER3P40054 469 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B SEC24P40482 926 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B KRI1P42846 591 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B YJR124CP47159 448 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B CTF18P49956 741 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B HFM1P51979 1187 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B YKE2P52553 114 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B VPS73P53142 486 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B RSC1P53236 928 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B ORC3P54790 616 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B INA17Q02888 182 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B ADI1Q03677 179 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B AIM32Q04689 311 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B ARG7Q04728 441 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B MDM30Q05930 598 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B PFA4Q12006 378 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B TSR3Q12094 313 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B SFI1Q12369 946 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B AI5_BETAQ9ZZX0 354 aa3.3□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B YPR089WO13585 888 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B TUB3P09734 445 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B MATALPHA2P0CY08 210 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B HMLALPHA2P0CY09 210 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B SCL1P21243 252 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B CDC11P32458 415 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B HOG1P32485 435 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B CDC13P32797 924 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B NOP4P37838 685 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B AXL2P38928 823 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B LYS1P38998 373 aaRIP-Chip data3.29□□□□□ -1.88not detected
tC(GCA)BtC(GCA)B AIM9P40053 627 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B THI6P41835 540 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B STU2P46675 888 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B RPS10BP46784 105 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B CPR7P47103 393 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B MND1P53102 219 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B ATF2P53296 535 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B ARE2P53629 642 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B STE20Q03497 939 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B TAF9Q05027 157 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B DON1Q05610 365 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B PSR2Q07949 397 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B YLR030WQ07967 263 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B RAX1Q08760 435 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B ECM3Q99252 613 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B BLM10P43583 2143 aa3.29□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B COX11P19516 300 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B MRPL8P22353 238 aa3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B MIH1P23748 554 aa3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B IMG1P25626 169 aa3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B IRS4P36115 615 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B SOL2P37262 315 aa3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B SAP1P39955 897 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B AIR1P40507 360 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B ASN2P49090 572 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B TAD1P53065 400 aa3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B YDR541CQ03049 344 aa3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B ARO80Q04052 950 aa3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B YPR114WQ06107 315 aa3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B AAD4Q07747 329 aa3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B DIS3Q08162 1001 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B YPL216WQ08964 1102 aa3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B VPS68Q12016 184 aa3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B RRP12Q12754 1228 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
tC(GCA)BtC(GCA)B CYC8P14922 966 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B MET16P18408 261 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B MNE1P24720 663 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RDS1P25611 832 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B MSP1P28737 362 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SKN1P33336 771 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B PET112P33893 541 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B EAP1P36041 632 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B ALY1P36117 915 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B VHC1P38329 1120 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B DED81P38707 554 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B GIC1P38785 314 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SLX8P40072 274 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B LRO1P40345 661 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SSU1P41930 458 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YFR020WP43600 232 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B SNG1P46950 547 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B IPI3P53877 555 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B KTR6P54070 446 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B GPD1Q00055 391 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B PPN1Q04119 674 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B ARA2Q04212 335 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B RRP45Q05636 305 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YLR407WQ06070 228 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B APC5Q08683 685 aa3.27□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B YPT1P01123 206 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
tC(GCA)BtC(GCA)B PMA2P19657 947 aa3.26□□□□□ -1.89
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