RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A CYK3Q07533 885 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CBP1P07252 654 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YEL1P34225 687 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A VID28P40547 921 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A COG8Q04632 607 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YMR317WQ04893 1140 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A MCH4Q08268 501 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A APL4Q12028 832 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YOL098CQ12496 1037 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A BIK1P11709 440 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SRV2P17555 526 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A MCM4P30665 933 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CBP4P37267 147 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A BET4Q00618 327 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A ARG7Q04728 441 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YLR407WQ06070 228 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A ATG33Q06485 197 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A RSA1Q08932 381 aa0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A PNO1Q99216 274 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CAP1P28495 268 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A GDA1P32621 518 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SOF1P33750 489 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YKR018CP36114 725 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A STB5P38699 743 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A UME6P39001 836 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A MIT1P40002 666 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YNL181WP53878 407 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A FDC1Q03034 503 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A NAM2P11325 894 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A HMG2P12684 1045 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CPR3P25719 182 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A BUD14P27637 709 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A MIC60P36112 540 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YTA12P40341 825 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SHE10P53075 577 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YGL117WP53133 265 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CBP3P21560 335 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A LCB1P25045 558 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YKU70P32807 602 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A MRPL4P36517 319 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CFD1P40558 293 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A BIT61P47041 543 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YPL107WQ02873 248 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A TAF8Q03750 510 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YLR112WQ12130 139 aa0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SSF2Q12153 453 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A FBP1P09201 348 aa0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A EHT1P38295 451 aa0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A GND1P38720 489 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YJR061WP40355 935 aa0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A GSM1P42950 618 aa0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A ATX2Q12067 313 aa0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A ERG27Q12452 347 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A RVB2Q12464 471 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A GLN4P13188 809 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YCR043CP25361 127 aa0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A MGR1P25573 417 aa0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A PLC1P32383 869 aa0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A KES1P35844 434 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A MNN4P36044 1178 aa0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A NSE3Q05541 303 aa0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A HIM1Q06674 414 aa0.62□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A MBR1P23493 339 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A PRE8P23639 250 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A TOM71P38825 639 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A TES1P41903 349 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A RET2P43621 546 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A LYS20P48570 428 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A GLO2Q05584 274 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SRL1Q08673 210 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A EDE1P34216 1381 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YEL076C-AP0CX16 216 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YLR464WP0CX17 216 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SEC62P21825 274 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A RPN2P32565 945 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A PTR2P32901 601 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A BET3P36149 193 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YEL076CP39971 216 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A TRE2Q08693 809 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A PMA2P19657 947 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A LAC1P28496 418 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A RAD24P32641 659 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A PDR3P33200 976 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A NUG1P40010 520 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A PRM2P40534 656 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A ELP2P42935 788 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CAF16P43569 289 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A PTR3P43606 678 aa0.61□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A DID4P36108 232 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SLX1P38324 304 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A MRX1P40050 688 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CAB2P40506 365 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A PMT3P47190 753 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A ECM9Q02202 377 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A YMR010WQ03687 405 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A CKB2P38930 258 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A UBP7P40453 1071 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SIM1P40472 476 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A MNT2P53059 558 aa0.6□□□□□ -2.31
YPL060C-AYPL060C-A SLD3P53135 668 aa0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 72.8 ms