RNA–Protein interactions for RNA: YIL039W

TED1, Transcript of Conserved phosphoesterase domain-containing protein, yeast

Gene TED1, Length 1,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TED1	YIL039W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	AAD3	P25612	363 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	TAF5	P38129	798 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	PIP2	P52960	996 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	TRS31	Q03337	283 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	WHI2	P12611	486 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	VPS34	P22543	875 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	VFA1	P40080	203 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	HIS6	P40545	261 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	QRI7	P43122	407 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	PCL8	Q08966	492 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	SNT2	P53127	1403 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	PAN1	P32521	1480 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	ATP4	P05626	244 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	PMA2	P19657	947 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	PTP2	P29461	750 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	CDC5	P32562	705 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	SDH8	P38345	138 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	YLF2	P38746	405 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	POL31	P46957	487 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	IRC20	Q06554	1556 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TED1	YIL039W	MSS18	P08593	268 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	YFL015C	P43578	164 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	IDS2	P46958	469 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	IMO32	P53219	342 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	TEP1	P53916	434 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	YNL092W	P53934	400 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	HIM1	Q06674	414 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	AAD4	Q07747	329 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	OSW1	Q08692	278 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	VPS15	P22219	1454 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	TAX4	P47030	604 aa		5	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	YML119W	Q03208	357 aa		5	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	DNF1	P32660	1571 aa		5	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	AAC1	P04710	309 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	GDA1	P32621	518 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	APM3	P38153	483 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	WAR1	Q03631	944 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	CRD1	Q07560	283 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	CTT1	P06115	562 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	PIF1	P07271	859 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	HEM1	P09950	548 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	YCR061W	P25639	631 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	YHL041W	P38730	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	VPS64	Q03944	604 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	CRF1	Q04930	467 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	ICL2	Q12031	575 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	AMD2	P22580	549 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	MRPL9	P31334	269 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	SPC72	P39723	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	ERG11	P10614	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	SIR1	P21691	654 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	HOT13	P36078	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	YJL043W	P47053	257 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	THI7	Q05998	598 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	CRT10	Q08226	957 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	AHA1	Q12449	350 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
TED1	YIL039W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TED1	YIL039W	POL3	P15436	1097 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TED1	YIL039W	EXO1	P39875	702 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TED1	YIL039W	UBP16	Q02863	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TED1	YIL039W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TED1	YIL039W	AIM6	Q07716	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TED1	YIL039W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TED1	YIL039W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TED1	YIL039W	PDR10	P51533	1564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TED1	YIL039W	ADE3	P07245	946 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms