RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGCS2P54868 508 aa33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 C7orf61Q8IZ16 206 aa33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 LRCH3Q96II8 777 aa33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 NEUROD6Q96NK8 337 aa33.84■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGCRP04035 888 aa33.83■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 GSTO1P78417 241 aa33.83■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 TFCP2Q12800 502 aa33.83■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF280CQ8ND82 737 aa33.83■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 MEIS3Q99687 375 aa33.83■■■■□ 3.01
CAPNS1-217ENST00000629983 LDHCP07864 332 aa33.82■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 GORABQ5T7V8 394 aa33.82■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 CDCA7LQ96GN5 454 aa33.82■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 RAI14Q9P0K7 980 aa33.81■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D2Q9BYX2 928 aa33.8■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 DLL1O00548 723 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 SRGAP3O43295 1099 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 NPM3O75607 178 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 HMG20BQ9P0W2 317 aa33.79■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 USP17L5A8MUK1 530 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 CAP2P40123 477 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX11Q8IYF3 940 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKLE1Q8NAG6 615 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF384Q8TF68 577 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 AS3MTQ9HBK9 375 aa33.78■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 PTPRFP10586 1907 aa33.77■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 PI16Q6UXB8 463 aa33.77■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA5Q8NB90 893 aa33.77■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 RPTORQ8N122 1335 aa33.77■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 PHIPQ8WWQ0 1821 aa33.76■■■■□ 3
CAPNS1-217ENST00000629983 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM32Q13049 653 aa33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 NBPF3Q9H094 633 aa33.76■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 GNAI3P08754 354 aa33.74■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP2B6P20813 491 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 GDF15Q99988 308 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf49Q9H6J7 331 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TMOD4Q9NZQ9 345 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 LRP2BPQ9P2M1 347 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 GJD2Q9UKL4 321 aa33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SYN1P17600 705 aa33.72■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 MTMR2Q13614 643 aa33.72■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3D19Q5HYK7 790 aa33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIB2Q92519 343 aa33.71■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM34Q9BYJ4 488 aa33.7■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 MORF4L1Q9UBU8 362 aa33.7■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
CAPNS1-217ENST00000629983 BMP8BP34820 402 aa33.69■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PI4KBQ9UBF8 816 aa33.69■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC285556D6RIA3 1793 aa33.69■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDT12Q9BQG2 462 aa33.68■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP33.67■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE3AQ14432 1141 aa33.67■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX10O60683 326 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 BAG3O95817 575 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ASNSP08243 561 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 MCAMP43121 646 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 BACE1P56817 501 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP33.66■■■□□ 2.988e-8■■■■□ 23.7
CAPNS1-217ENST00000629983 MTX1Q13505 466 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB123Q8N688 67 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 SOCS4Q8WXH5 440 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR18Q9BV38 432 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 OGDHLQ9ULD0 1010 aa33.66■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa33.65■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 DOCK3Q8IZD9 2030 aa33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 HERVK_113P62684 666 aa33.64■■■□□ 2.98
CAPNS1-217ENST00000629983 GDF11O95390 407 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 PLCG2P16885 1265 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TXNRD2Q9NNW7 524 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SNRKQ9NRH2 765 aa33.63■■■□□ 2.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ALPK3Q96L96 1907 aa33.63■■■□□ 2.97
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