RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 UBXN2AP68543 259 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 GADL1Q6ZQY3 521 aa29.59■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ADCY3O60266 1144 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 ELNP15502 786 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa29.58■■■□□ 2.33
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SGPL1O95470 568 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 IRF5Q13568 498 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCF2Q9UG63 623 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 COL6A3P12111 3177 aa29.57■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1B0GUL7 405 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM75PA6NK02 468 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 INHAP05111 366 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 MECOMQ03112 1051 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PICALMQ13492 652 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TREML2Q5T2D2 321 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PXYLP1Q8TE99 480 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 XAGE2Q96GT9 111 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa29.56■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D12O60347 775 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 HTATIP2Q9BUP3 242 aa29.55■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM196BA6NMK8 535 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 NPM3O75607 178 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 IGHDP01880 384 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TFCP2Q12800 502 aa29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 MTX1Q13505 466 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 PI16Q6UXB8 463 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 LOC285556D6RIA3 1793 aa29.53■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SLF2Q8IX21 1173 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 HMG20BQ9P0W2 317 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ALPK3Q96L96 1907 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.52■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.32
CAPNS1-216ENST00000628306 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM110CQ1W6H9 321 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ERICH6Q7L0X2 663 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 DEFB118Q96PH6 123 aa29.5■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SIPA1L1O43166 1804 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ATAD5Q96QE3 1844 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SRGAP3O43295 1099 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 AKAP2Q9Y2D5 859 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 NR2E3Q9Y5X4 410 aa29.48■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 GNAI3P08754 354 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SPP2Q13103 211 aa29.47■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATA5Q8NB90 893 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 GJD2Q9UKL4 321 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0C4DFX4 3053 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF280CQ8ND82 737 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PLXNB2O15031 1838 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TFRCP02786 760 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CAP2P40123 477 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 CAPN2P17655 700 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 MCAMP43121 646 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 HMGCS2P54868 508 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SMC5Q8IY18 1101 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 COA7Q96BR5 231 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PNMA3Q9UL41 463 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 JAG1P78504 1218 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 NEUROD6Q96NK8 337 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM32Q13049 653 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 EVI5O60447 810 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 LDHCP07864 332 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TAOK2Q9UL54 1235 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A1W2PPC1 479 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 GSTO1P78417 241 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 DNAJC18Q9H819 358 aa29.39■■■□□ 2.3
CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L5A8MUK1 530 aa29.39■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 GNAI2P04899 355 aa29.39■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 RAI14Q9P0K7 980 aa29.39■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.39■■■□□ 2.29
CAPNS1-216ENST00000628306 STAP2Q9UGK3 403 aa29.39■■■□□ 2.29
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