RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613876.1

CCL23-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 23, humanhuman

TSL 3

Gene CCL23, Length 402 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23-202ENST00000613876 TOMM22Q9NS69 142 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 FOCADQ5VW36 1801 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 MYH1P12882 1939 aa6.27□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 NPM3O75607 178 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 CDK8P49336 464 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 MMP14P50281 582 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 CCT2P78371 535 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SCRN1Q12765 414 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 NFIAQ12857 509 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 PICALMQ13492 652 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 DLGAP5Q15398 846 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SEC23AQ15436 765 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 FAM47AQ5JRC9 791 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 TTC6Q86TZ1 520 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SGMS1Q86VZ5 419 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 TMTC2Q8N394 836 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 MTMR14Q8NCE2 650 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 GTF3C6Q969F1 213 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SMC3Q9UQE7 1217 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ROBO3Q96MS0 1386 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 LAMB1P07942 1786 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 NAV1Q8NEY1 1877 aa6.26□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SHTN1A0MZ66 631 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ERICH2A1L162 156 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SPDYE2BA6NHP3 402 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 CCDC69A6NI79 296 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 DTNBO60941 627 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 CTDNEP1O95476 244 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SPDYE6P0CI01 402 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 LMNB1P20700 586 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 RASA1P20936 1047 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 GJB2P29033 226 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 NT5C2P49902 561 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 CACNB3P54284 484 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 NUCB2P80303 420 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 TFAP4Q01664 338 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 GABPAQ06546 454 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 WTAPQ15007 396 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SART3Q15020 963 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 OGFOD1Q8N543 542 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 DPF2Q92785 391 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 CHMP4CQ96CF2 233 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 GJA3Q9Y6H8 435 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 TNKSO95271 1327 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.25□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SBF1O95248 1867 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 CLRN2A0PK11 232 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 TSPY2A6NKD2 308 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 GOLGA8BA8MQT2 603 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 TCP10L2B9ZVM9 353 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 WNT10BO00744 389 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ZBTB43O43298 467 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 NMT2O60551 498 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 JAK2O60674 1132 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ENTPD3O75355 529 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 HLA-DOAP06340 250 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 TSPY3P0CV98 308 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 TSPY8P0CW00 308 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 ADD1P35611 737 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 TCP10Q12799 353 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 PKP1Q13835 747 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 NBPF9Q3BBW0 867 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 SPDYE2Q495Y8 402 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.24□□□□□ -1.41
CCL23-202ENST00000613876 FKBP1CQ5VVH2 108 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms