RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597316.1

TRPM4-208, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRPM4, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM4-208ENST00000597316 ANKLE1Q8NAG6 615 aa21.65■■□□□ 1.06
TRPM4-208ENST00000597316 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.65■■□□□ 1.06
TRPM4-208ENST00000597316 HMGCRP04035 888 aa21.64■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 TFCP2Q12800 502 aa21.64■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.64■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 FAM196BA6NMK8 535 aa21.63■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 CAP2P40123 477 aa21.63■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 HMGCS2P54868 508 aa21.63■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 ZNF384Q8TF68 577 aa21.63■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.63■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 MEIS3Q99687 375 aa21.63■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 GJD2Q9UKL4 321 aa21.63■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 RPTORQ8N122 1335 aa21.62■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 USP17L5A8MUK1 530 aa21.62■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 SRGAP3O43295 1099 aa21.62■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 GORABQ5T7V8 394 aa21.62■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 LRCH3Q96II8 777 aa21.62■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.62■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.62■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 MGAMO43451 1857 aa21.61■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 DLL1O00548 723 aa21.61■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 BMP8BP34820 402 aa21.61■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 SPATA5Q8NB90 893 aa21.61■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 NBPF3Q9H094 633 aa21.61■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 RAI14Q9P0K7 980 aa21.61■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 DOCK2Q92608 1830 aa21.6■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 GNAI3P08754 354 aa21.6■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.6■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa21.6■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 GDF15Q99988 308 aa21.6■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.6■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 C7orf61Q8IZ16 206 aa21.59■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 MTX1Q13505 466 aa21.58■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 TEX11Q8IYF3 940 aa21.58■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.58■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.58■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 MORF4L1Q9UBU8 362 aa21.58■■□□□ 1.05
TRPM4-208ENST00000597316 LAMA3Q16787 3333 aa21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 TRIM32Q13049 653 aa21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 GPR153Q6NV75 609 aa21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 PI16Q6UXB8 463 aa21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 WDR18Q9BV38 432 aa21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 C11orf49Q9H6J7 331 aa21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 DOCK1Q14185 1865 aa21.56■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 BACE1P56817 501 aa21.56■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 OGDHLQ9ULD0 1010 aa21.56■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 BAG3O95817 575 aa21.55■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 ASNSP08243 561 aa21.55■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 CYP2B6P20813 491 aa21.55■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 MTMR2Q13614 643 aa21.55■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa21.55■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 TRIB2Q92519 343 aa21.55■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.55■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.55■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 C19orf81C9J6K1 198 aa21.54■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.54■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.54■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 PTPRFP10586 1907 aa21.53■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 PLCG2P16885 1265 aa21.53■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 SYN1P17600 705 aa21.53■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 MCAMP43121 646 aa21.53■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.53■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.53■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 TRIM34Q9BYJ4 488 aa21.53■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 USP17L10C9JJH3 530 aa21.52■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 RARSP54136 660 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 HERVK_113P62684 666 aa21.52■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 PDE3AQ14432 1141 aa21.52■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.52■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 DEFB123Q8N688 67 aa21.52■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 GINM1Q9NU53 330 aa21.52■■□□□ 1.04
TRPM4-208ENST00000597316 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms