RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SEPT6Q14141 434 aa8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CEP41Q9BYV8 373 aa8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FMN1Q68DA7 1419 aa8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RICTORQ6R327 1708 aa8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa8.51□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RAPGEF3O95398 923 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TIAF1O95411 115 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLFN14P0C7P3 912 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PWP1Q13610 501 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CEP162Q5TB80 1403 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GPAT2Q6NUI2 795 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.5□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.49□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADH5P11766 374 aa8.49□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF394Q53GI3 561 aa8.49□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RHOVQ96L33 236 aa8.49□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.49□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.49□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TCF3P15923 654 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LMNB2Q03252 620 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DYMQ7RTS9 669 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP48Q86UV5 1035 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NT5DC4Q86YG4 428 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TP53INP1Q96A56 240 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CSADQ9Y600 493 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.48□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PLCH2O75038 1416 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 AKNAQ7Z591 1439 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NEO1Q92859 1461 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FYCO1Q9BQS8 1478 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMPRSS2O15393 492 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CDK8P49336 464 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ID3Q02535 119 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.47□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADGRL1O94910 1474 aa8.46□□□□□ -1.05
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MSTNO14793 375 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PROCP04070 461 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DOC2BQ14184 412 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 INPP5AQ14642 412 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SNAP47Q5SQN1 464 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GOLM1Q8NBJ4 401 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.46□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FANCAO15360 1455 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 F13A1P00488 732 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ASPAP45381 313 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 USP11P51784 963 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C12orf40Q86WS4 652 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DISC1Q9NRI5 854 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM105AQ9NUU6 356 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa8.45□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PREX2Q70Z35 1606 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BMP3P12645 472 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GARTP22102 1010 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UVSSAQ2YD98 709 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SGO2Q562F6 1265 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.44□□□□□ -1.06
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms