RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 SULF2Q8IWU5 870 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 SPATA32Q96LK8 384 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 ATP7AQ04656 1500 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 FSCN2O14926 492 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 CDC25BP30305 580 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 SOGA3Q5TF21 947 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 TREML4Q6UXN2 200 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 DGKGP49619 791 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 AP3B2Q13367 1082 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 SETDB1Q15047 1291 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC14Q15048 493 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 LNPKQ9C0E8 428 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 DEPDC5O75140 1603 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 PREX2Q70Z35 1606 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 PLXNC1O60486 1568 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC7Q96NW7 1537 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 JCADQ9P266 1359 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 FAM221AA4D161 298 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 FGRP09769 529 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 LMNB1P20700 586 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 AMPD1P23109 780 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 GSTM4Q03013 218 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 FAM117BQ6P1L5 589 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRM-208ENST00000578600 MTUS2Q5JR59 1369 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 F13A1P00488 732 aa7.89□□□□□ -1.15
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PTPRM-208ENST00000578600 KCNA6P17658 529 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 CRKP46108 304 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 ARL4DP49703 201 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 LRRC3Q9BY71 257 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 ITSN2Q9NZM3 1697 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 SYNMO15061 1565 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 VWDEQ8N2E2 1590 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM37O94972 964 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRM-208ENST00000578600 RBL2Q08999 1139 aa7.88□□□□□ -1.15
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PTPRM-208ENST00000578600 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 UBP1Q9NZI7 540 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 SYCP2Q9BX26 1530 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRM-208ENST00000578600 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
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