RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 A0A0C4DFX4 3053 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa6.61□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAF1P21675 1872 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 ABCC12Q96J65 1359 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 UBN2Q6ZU65 1347 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 MYL6BP14649 208 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 RHOQP17081 205 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 CRY2Q49AN0 593 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCDC93Q567U6 631 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAS1R3Q7RTX0 852 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRP10Q7Z4F1 713 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 RHBDD1Q8TEB9 315 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 NYXQ9GZU5 481 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 IQCA1LA6NCM1 817 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM177BA6PVY3 158 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 LGR5O75473 907 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 PHKA2P46019 1235 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 RIPK4P57078 832 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 WDR44Q5JSH3 913 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TBCELQ5QJ74 424 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM164Q5U3C3 297 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 NGEFQ8N5V2 710 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 STK32AQ8WU08 396 aa6.59□□□□□ -1.35
TRAPPC8-202ENST00000577426 LRRC37AA6NMS7 1700 aa6.59□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 COL4A5P29400 1685 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 NTSR2O95665 410 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 GPTP24298 496 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 ALDH1B1P30837 517 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 EPHA4P54764 986 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 FOXK2Q01167 660 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 PTSQ03393 145 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDE4CQ08493 712 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 C4orf17Q53FE4 359 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 SUSD4Q5VX71 490 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 OLFM4Q6UX06 510 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 CHMP3Q9Y3E7 222 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 LTBP1Q14766 1721 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.58□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 CHL1O00533 1208 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 NOS2P35228 1153 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 PROSER3Q2NL68 480 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 PARP10Q53GL7 1025 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 RUNDC1Q96C34 613 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 PSMD1Q99460 953 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 USP3Q9Y6I4 520 aa6.57□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF541Q9H0D2 1346 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERTM1A2A2V5 107 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 H0YGN5 161 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 FZD9O00144 591 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 ANXA1P04083 346 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 TEAD4Q15561 434 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC10A5Q5PT55 438 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 SYNE4Q8N205 404 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRIMPOLQ96LW4 560 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC35F4A4IF30 521 aa6.55□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 PRMT3O60678 531 aa6.55□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 IGFBP4P22692 258 aa6.55□□□□□ -1.36
TRAPPC8-202ENST00000577426 PLA2G4AP47712 749 aa6.55□□□□□ -1.36
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