RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.74■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 HLA-DOAP06340 250 aa22.74■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.74■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.74■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.74■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 JMYQ8N9B5 988 aa22.74■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 RASA3Q14644 834 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 MYH4Q9Y623 1939 aa22.73■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 E7EWF7 191 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 KRT32Q14532 448 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 LDHDQ86WU2 507 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.72■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 CSRNP1Q96S65 589 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.71■■□□□ 1.23
CTU2-204ENST00000564105 IL17RAQ96F46 866 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 KIF2CQ99661 725 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 INCENPQ9NQS7 918 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.7■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 PDE4BQ07343 736 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 TEPSINQ96N21 525 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 EHD4Q9H223 541 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.69■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 NEDD4P46934 1319 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 PASKQ96RG2 1323 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 TRDNQ13061 729 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 SULF1Q8IWU6 871 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 NCOA7Q8NI08 942 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 TOMM22Q9NS69 142 aa22.68■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 FGRP09769 529 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 PSMA5P28066 241 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 GABPAQ06546 454 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 NEK1Q96PY6 1258 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 DOCK1Q14185 1865 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 PRDM1O75626 825 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 CDK8P49336 464 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 KRT23Q9C075 422 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 SWAP70Q9UH65 585 aa22.67■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 OTOFQ9HC10 1997 aa22.66■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.66■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 FAM196BA6NMK8 535 aa22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 B4E1Z4 1266 aa22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 ADM5C9JUS6 153 aa22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 ORC4O43929 436 aa22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 SLURP2P0DP57 97 aa22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 CREBZFQ9NS37 354 aa22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.65■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 DNAJC18Q9H819 358 aa22.64■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.64■■□□□ 1.22
CTU2-204ENST00000564105 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 CPA1P15085 419 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 RABEP1Q15276 862 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 USP48Q86UV5 1035 aa22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
CTU2-204ENST00000564105 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
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