RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 IDI2Q9BXS1 227 aa20.33■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 EVX2Q03828 476 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.32■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPM3O75607 178 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 CACNB3P54284 484 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDE4BQ07343 736 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYH1P12882 1939 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLRN2A0PK11 232 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLTPD2A6NH11 291 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRDM1O75626 825 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANTXR2P58335 489 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 NFIAQ12857 509 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 ESR2Q92731 530 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR19Q8NEZ3 1342 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 LARGE1O95461 756 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPS15P42566 896 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 ME3Q16798 604 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLCD1P51178 756 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 APOBRQ0VD83 1088 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 STK3Q13188 491 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 VEZTQ9HBM0 779 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 ENTPD3O75355 529 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 EGFRP00533 1210 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCP10Q12799 353 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 CUL4AQ13619 759 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTC6Q86TZ1 520 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM198AQ9UFP1 575 aa20.29■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 TCP10L2B9ZVM9 353 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC83Q8IWF9 413 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM87BQ96K49 555 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERICH2A1L162 156 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 HLA-DOAP06340 250 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 FGRP09769 529 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 NECAB1Q8N987 351 aa20.27■□□□□ 0.84
USP3-AS1-201ENST00000558831 ORC4O43929 436 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNNI2P48788 182 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 TNFAIP1Q13829 316 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 FBXL16Q8N461 479 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 HACL1Q9UJ83 578 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM47AQ5JRC9 791 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM83AQ86UY5 434 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM151AQ8WW52 585 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.25■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 TSPY2A6NKD2 308 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 IQCA1Q86XH1 822 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFPM1Q8IX07 1006 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDK8P49336 464 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 WTAPQ15007 396 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 C16orf86Q6ZW13 317 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 SCN4AP35499 1836 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATRNL1Q5VV63 1379 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC69A6NI79 296 aa20.23■□□□□ 0.83
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.7 ms