RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553309.5

ATXN3-218, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,022 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-218ENST00000553309 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.35□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.35□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 PIM2Q9P1W9 311 aa8.35□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 SHROOM2Q13796 1616 aa8.35□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 FAM170BA6NMN3 283 aa8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 CD97P48960 835 aa8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 ERVK-24P63145 666 aa8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 DUSP27Q5VZP5 1158 aa8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 C12orf40Q86WS4 652 aa8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 GATA6Q92908 595 aa8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
ATXN3-218ENST00000553309 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 ADCY10Q96PN6 1610 aa8.33□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.33□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 SORBS3O60504 671 aa8.33□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 NUP160Q12769 1436 aa8.33□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.33□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 NBPF11Q86T75 865 aa8.33□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 RNF214Q8ND24 703 aa8.33□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 CTSHP09668 335 aa8.32□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 MAP3K11Q16584 847 aa8.32□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 PPM1JQ5JR12 505 aa8.32□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 OGFOD3Q6PK18 319 aa8.32□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 BCL2L13Q9BXK5 485 aa8.32□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 MRS2Q9HD23 443 aa8.32□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 PICK1Q9NRD5 415 aa8.32□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 NEFMP07197 916 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 LMNB1P20700 586 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 CYP27A1Q02318 531 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 ISL2Q96A47 359 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 USP31Q70CQ4 1352 aa8.31□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 CYP26A1O43174 497 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 FOSL1P15407 271 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 RPS26P62854 115 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 RING1Q06587 406 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 CDK5R2Q13319 367 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 INPP5AQ14642 412 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 ST13P50502 369 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 AGMOQ6ZNB7 445 aa8.29□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.29□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 TOP2BQ02880 1626 aa8.29□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 CUX1P39880 1505 aa8.29□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 ADAMTS12P58397 1594 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 FANCGO15287 622 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 RLBP1P12271 317 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 LIG3P49916 1009 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 LRFN4Q6PJG9 635 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 HDXQ7Z353 690 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 DTX1Q86Y01 620 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 GIPC2Q8TF65 315 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.28□□□□□ -1.08
ATXN3-218ENST00000553309 FAM87AP0C7U9 286 aa8.27□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 ITGAEP38570 1179 aa8.27□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.27□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 SPINK2P20155 84 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 NTF4P34130 210 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 CDK8P49336 464 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 SEPT6Q14141 434 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 CYFIP1Q7L576 1253 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 GAL3ST3Q96A11 431 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 CRELD1Q96HD1 420 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.26□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 LEFTY1O75610 366 aa8.25□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.25□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa8.25□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.24□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 ADAMTS4O75173 837 aa8.24□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.24□□□□□ -1.09
ATXN3-218ENST00000553309 RELL1Q8IUW5 271 aa8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms