RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 ACSBG1Q96GR2 724 aa8.44□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 TNKS2Q9H2K2 1166 aa8.43□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 CBX8Q9HC52 389 aa8.43□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 SNX11Q9Y5W9 270 aa8.43□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 DBX1A6NMT0 343 aa8.42□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa8.42□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 PKN1Q16512 942 aa8.42□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.42□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.42□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 TMC7Q7Z402 723 aa8.42□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.42□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.41□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 PPM1JQ5JR12 505 aa8.41□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 KSR1Q8IVT5 923 aa8.41□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 CSADQ9Y600 493 aa8.41□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa8.4□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa8.4□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.4□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 ASB11Q8WXH4 323 aa8.4□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 PRDM10Q9NQV6 1147 aa8.4□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 PRDM7Q9NQW5 492 aa8.4□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 PICK1Q9NRD5 415 aa8.4□□□□□ -1.06
USP15-218ENST00000552346 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.39□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.39□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 IKZF1Q13422 519 aa8.39□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 FLAD1Q8NFF5 587 aa8.39□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 SLC38A3Q99624 504 aa8.39□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa8.39□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.38□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 TCF3P15923 654 aa8.38□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 SPACA3Q8IXA5 215 aa8.38□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.38□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa8.38□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 NTF4P34130 210 aa8.37□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 PLCB3Q01970 1234 aa8.37□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 ZP2Q05996 745 aa8.37□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.37□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 UBE3DQ7Z6J8 389 aa8.37□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.37□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 SAMM50Q9Y512 469 aa8.37□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 TRIM37O94972 964 aa8.36□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 BMP6P22004 513 aa8.36□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 DSC3Q14574 896 aa8.36□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 C12orf40Q86WS4 652 aa8.36□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 GNAT3A8MTJ3 354 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 ENC1O14682 589 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 FANCGO15287 622 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 GSTT1P30711 240 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 KCNMB1Q16558 191 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 NKPD1Q17RQ9 610 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 CDC37L1Q7L3B6 337 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 FAM84AQ96KN4 292 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 CEP44Q9C0F1 390 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 BCL11AQ9H165 835 aa8.35□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 TREHO43280 583 aa8.34□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 PAGE1O75459 146 aa8.34□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 RING1Q06587 406 aa8.34□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 MESP2Q0VG99 397 aa8.34□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.34□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.34□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 FAM53CQ9NYF3 392 aa8.34□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
USP15-218ENST00000552346 EOMESO95936 686 aa8.33□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 CLCN7P51798 805 aa8.33□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 MLANAQ16655 118 aa8.33□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 KCT2Q8NC54 265 aa8.33□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.33□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 CTNND2Q9UQB3 1225 aa8.33□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 FBXO24O75426 580 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 FGD1P98174 961 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 LRRC14Q15048 493 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 FBLN7Q53RD9 439 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 FOXQ1Q9C009 403 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.32□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 RECKO95980 971 aa8.31□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 ELMO3Q96BJ8 720 aa8.31□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 C8orf37Q96NL8 207 aa8.31□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 USP35Q9P2H5 1018 aa8.31□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa8.31□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 LRIG2O94898 1065 aa8.3□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 AFMP43652 599 aa8.3□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 LCE4AQ5TA78 99 aa8.3□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 RASIP1Q5U651 963 aa8.3□□□□□ -1.08
USP15-218ENST00000552346 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms