RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549355.1

PTPRQ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRQ, Length 567 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-204ENST00000549355 DIP2BQ9P265 1576 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 OVOL3O00110 214 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 EREGO14944 169 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 PCDH1Q08174 1060 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 CELA3BP08861 270 aa7□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 CRELD1Q96HD1 420 aa7□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 DISC1Q9NRI5 854 aa7□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 A6NHS1 94 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 EFEMP1Q12805 493 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 EFCAB5A4FU69 1503 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP6.98□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 UBTFP17480 764 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 ATCAYQ86WG3 371 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 VRTNQ9H8Y1 702 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 CD109Q6YHK3 1445 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 FMN1Q68DA7 1419 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 ABCA8O94911 1581 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRQ-204ENST00000549355 EDN3P14138 238 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 CORO1BQ9BR76 489 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 KDM6BO15054 1643 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A096LPE4 126 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 A0A1W2PPZ6 126 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 ABTB2Q8N961 1025 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 KIF21BO75037 1637 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 PRMT3O60678 531 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 CLCN7P51798 805 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 ATP10BO94823 1461 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 NEO1Q92859 1461 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 B3GALT4O96024 378 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 NEFMP07197 916 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 INSRRP14616 1297 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 TTLL4Q14679 1199 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 SPRED3Q2MJR0 410 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 PIDD1Q9HB75 910 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 SAMD9Q5K651 1589 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 LIG1P18858 919 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 GRIA4P48058 902 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 DLG4P78352 724 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 GLMNQ92990 594 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 ZNF862O60290 1169 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 ID3Q02535 119 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 SWI5Q1ZZU3 235 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 SPATS1Q496A3 300 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 CCNJLQ8IV13 435 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 ABHD4Q8TB40 342 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 EDEM1Q92611 657 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 GCM1Q9NP62 436 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 CLIP1P30622 1438 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 PDGFAP04085 211 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 PDE3AQ14432 1141 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 TCF12Q99081 682 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRQ-204ENST00000549355 CFAP43Q8NDM7 1665 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 TNFRSF21O75509 655 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRQ-204ENST00000549355 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms