RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 SPP2Q13103 211 aa29.59■■■□□ 2.33
PRDM4-202ENST00000547188 CCL14Q16627 93 aa29.59■■■□□ 2.33
PRDM4-202ENST00000547188 NUDT12Q9BQG2 462 aa29.59■■■□□ 2.33
PRDM4-202ENST00000547188 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa29.59■■■□□ 2.33
PRDM4-202ENST00000547188 ATAD5Q96QE3 1844 aa29.59■■■□□ 2.33
PRDM4-202ENST00000547188 HMGCS2P54868 508 aa29.58■■■□□ 2.33
PRDM4-202ENST00000547188 ENTPD3O75355 529 aa29.57■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 KLHDC4Q8TBB5 520 aa29.56■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 IDI2Q9BXS1 227 aa29.56■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.56■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 FAM196BA6NMK8 535 aa29.55■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 NCOR1O75376 2440 aa29.55■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 FGFR2P21802 821 aa29.54■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 RTP1P59025 263 aa29.54■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.54■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 SOCS4Q8WXH5 440 aa29.54■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 PICALMQ13492 652 aa29.53■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 RFX7Q2KHR2 1363 aa29.52■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 KIF16BQ96L93 1317 aa29.52■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF280CQ8ND82 737 aa29.52■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.52■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa29.52■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 RLFQ13129 1914 aa29.51■■■□□ 2.32
PRDM4-202ENST00000547188 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP29.51■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 PDE3AQ14432 1141 aa29.51■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 SLC4A10Q6U841 1118 aa29.51■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 BADQ92934 168 aa29.51■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 VAMP4O75379 141 aa29.5■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 MAP3K12Q12852 859 aa29.5■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 USP6NLQ92738 828 aa29.5■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 ALDH1L1O75891 902 aa29.49■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 GRIN2CQ14957 1233 aa29.48■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 ANKRD44Q8N8A2 993 aa29.48■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa29.48■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa29.48■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 SLC5A1P13866 664 aa29.47■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 RGS2P41220 211 aa29.47■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 PORCNQ9H237 461 aa29.47■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 MYO9BQ13459 2157 aa29.47■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 Q3C1V9 767 aa29.46■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 SH3D19Q5HYK7 790 aa29.45■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 MORN1Q5T089 497 aa29.45■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 GPR142Q7Z601 462 aa29.45■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 WWC1Q8IX03 1113 aa29.45■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 PPM1EQ8WY54 764 aa29.45■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 APBA2Q99767 749 aa29.45■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
PRDM4-202ENST00000547188 MAPK4P31152 587 aa29.44■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 RBPJLQ9UBG7 517 aa29.44■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 BDP1A6H8Y1 2624 aa29.44■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 GAKO14976 1311 aa29.44■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.44■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 CNGA1P29973 690 aa29.43■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 HERVK_113P62684 666 aa29.43■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 LPIN2Q92539 896 aa29.43■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 FLRT1Q9NZU1 646 aa29.43■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 USP17L5A8MUK1 530 aa29.42■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 TBC1D12O60347 775 aa29.42■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa29.42■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.42■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa29.42■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 DNM1LO00429 736 aa29.41■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 BTDP43251 543 aa29.41■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 MTMR2Q13614 643 aa29.41■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 LPAR1Q92633 364 aa29.41■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 PAGR1Q9BTK6 254 aa29.41■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa29.41■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.41■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 ERVK-9P63128 1117 aa29.4■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 ERVK-24P63145 666 aa29.4■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa29.4■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 TRIM43BA6NCK2 446 aa29.39■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 CAP2P40123 477 aa29.39■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 TRIM60Q495X7 471 aa29.39■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 MFSD14CQ5VZR4 134 aa29.39■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP29.39■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.39■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 PDLIM7Q9NR12 457 aa29.39■■■□□ 2.3
PRDM4-202ENST00000547188 UTYO14607 1347 aa29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.6 ms