RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.79■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
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TSTA3-211ENST00000529899 CAP1Q01518 475 aa22.78■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 PPATQ06203 517 aa22.78■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.78■■□□□ 1.24
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TSTA3-211ENST00000529899 LCORLQ8N3X6 602 aa22.77■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 ABHD8Q96I13 439 aa22.77■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 ECHDC1Q9NTX5 307 aa22.77■■□□□ 1.24
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TSTA3-211ENST00000529899 MBD4O95243 580 aa22.72■■□□□ 1.23
TSTA3-211ENST00000529899 GDF11O95390 407 aa22.72■■□□□ 1.23
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TSTA3-211ENST00000529899 CAP2P40123 477 aa22.71■■□□□ 1.23
TSTA3-211ENST00000529899 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TSTA3-211ENST00000529899 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.71■■□□□ 1.23
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TSTA3-211ENST00000529899 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.71■■□□□ 1.23
TSTA3-211ENST00000529899 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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TSTA3-211ENST00000529899 CD99L2Q8TCZ2 262 aa22.71■■□□□ 1.23
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TSTA3-211ENST00000529899 IGHDP01880 384 aa22.7■■□□□ 1.22
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TSTA3-211ENST00000529899 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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TSTA3-211ENST00000529899 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.7■■□□□ 1.22
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TSTA3-211ENST00000529899 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.68■■□□□ 1.22
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TSTA3-211ENST00000529899 MX1P20591 662 aa22.67■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.67■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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TSTA3-211ENST00000529899 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.66■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 CYP2C8P10632 490 aa22.66■■□□□ 1.22
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TSTA3-211ENST00000529899 CPA4Q9UI42 421 aa22.66■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 MYH8P13535 1937 aa22.66■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 SP3Q02447 781 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 TREML2Q5T2D2 321 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 LNPKQ9C0E8 428 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 TRIM17Q9Y577 477 aa22.65■■□□□ 1.22
TSTA3-211ENST00000529899 TLR2O60603 784 aa22.64■■□□□ 1.21
TSTA3-211ENST00000529899 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
TSTA3-211ENST00000529899 SHMT1P34896 483 aa22.64■■□□□ 1.21
TSTA3-211ENST00000529899 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.64■■□□□ 1.21
TSTA3-211ENST00000529899 OSBP2Q969R2 916 aa22.64■■□□□ 1.21
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