RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 FAM196BA6NMK8 535 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 SPP2Q13103 211 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 GORABQ5T7V8 394 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 SPATA5Q8NB90 893 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF280CQ8ND82 737 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 DOCK2Q92608 1830 aa19.89■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP19.89■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 EVI5O60447 810 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 TBC1D2Q9BYX2 928 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 TAOK2Q9UL54 1235 aa19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP19.88■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 CAP2P40123 477 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP19.87■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP19.87■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 PI16Q6UXB8 463 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 RAI14Q9P0K7 980 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 MGAMO43451 1857 aa19.87■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 USP17L5A8MUK1 530 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 HMGCS2P54868 508 aa19.85■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 DOCK1Q14185 1865 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 A0A1W2PPC1 479 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 SH3D19Q5HYK7 790 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 NECAB2Q7Z6G3 386 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 TEX11Q8IYF3 940 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 LRP2BPQ9P2M1 347 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 GJD2Q9UKL4 321 aa19.84■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 PHIPQ8WWQ0 1821 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 PTPRFP10586 1907 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 HMGCRP04035 888 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 GNAI2P04899 355 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 MCAMP43121 646 aa19.83■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
PTPRU-210ENST00000527027 AS3MTQ9HBK9 375 aa19.83■□□□□ 0.77
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PTPRU-210ENST00000527027 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 ANKLE1Q8NAG6 615 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 WDR18Q9BV38 432 aa19.82■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
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PTPRU-210ENST00000527027 MORF4L1Q9UBU8 362 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 STAP2Q9UGK3 403 aa19.81■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 DOCK3Q8IZD9 2030 aa19.8■□□□□ 0.76
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PTPRU-210ENST00000527027 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 ASNSP08243 561 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 TRIM27P14373 513 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 PLCG2P16885 1265 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP19.79■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 TMOD4Q9NZQ9 345 aa19.79■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 TRIM32Q13049 653 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 MTMR2Q13614 643 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 NBPF3Q9H094 633 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 GPR108Q9NPR9 543 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 SNRKQ9NRH2 765 aa19.78■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 C19orf81C9J6K1 198 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 JAG1P78504 1218 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 CCDC158Q5M9N0 1113 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 TTC39AQ5SRH9 613 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 GINM1Q9NU53 330 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 TNNQ9UQP3 1299 aa19.77■□□□□ 0.76
PTPRU-210ENST00000527027 A0A0C4DFX4 3053 aa19.77■□□□□ 0.76
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PTPRU-210ENST00000527027 USP17L10C9JJH3 530 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-210ENST00000527027 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-210ENST00000527027 IGSF3O75054 1194 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-210ENST00000527027 CYP2B6P20813 491 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-210ENST00000527027 BMP8BP34820 402 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-210ENST00000527027 HERVK_113P62684 666 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-210ENST00000527027 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-210ENST00000527027 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-210ENST00000527027 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-210ENST00000527027 TRIB2Q92519 343 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-210ENST00000527027 GDF15Q99988 308 aa19.76■□□□□ 0.75
PTPRU-210ENST00000527027 TRIM34Q9BYJ4 488 aa19.76■□□□□ 0.75
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