RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514640.5

ZBED3-AS1-214, ZBED3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ZBED3-AS1, Length 1,300 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 KIF3AQ9Y496 699 aa9.51□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PSME4Q14997 1843 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CHGBP05060 677 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GYS1P13807 737 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MCM5P33992 734 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 RCAN1P53805 252 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GRAPQ13588 217 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 WASHC4Q2M389 1173 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CAVIN4Q5BKX8 364 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CNBD1Q8NA66 436 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 NCOA7Q8NI08 942 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.5□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ELP1O95163 1332 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GPR37O15354 613 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 F13A1P00488 732 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CPA1P15085 419 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GJB2P29033 226 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF697Q5TEC3 545 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 Q6ZUG5 572 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CCDC83Q8IWF9 413 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SPSB2Q99619 263 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CNNM2Q9H8M5 875 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MTMR6Q9Y217 621 aa9.49□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 XDHP47989 1333 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF213O14771 459 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 IDH1O75874 414 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 KCNQ4P56696 695 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF445P59923 1031 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TXNRD1Q16881 649 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ATL3Q6DD88 541 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PRR5LQ6MZQ0 368 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SGMS1Q86VZ5 419 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CERS3Q8IU89 383 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 AIDAQ96BJ3 306 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TMEM87BQ96K49 555 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MYH8P13535 1937 aa9.48□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MYH1P12882 1939 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 FAM177BA6PVY3 158 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 FGRP09769 529 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 LIFRP42702 1097 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ST5P78524 1137 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 PKDCCQ504Y2 493 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 FAM182BQ5T319 152 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MCTP1Q6DN14 999 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 BRF1Q92994 677 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 NACAP1Q9BZK3 213 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.47□□□□□ -0.89
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 GSG1L2A8MUP6 293 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 BBOX1O75936 387 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ANTXR2P58335 489 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 FUT2Q10981 343 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TRDNQ13061 729 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SLFNL1Q499Z3 407 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZNF787Q6DD87 383 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 IFNL3Q8IZI9 196 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 NLGN1Q8N2Q7 840 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 KRT23Q9C075 422 aa9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 TNFRSF10AO00220 468 aa9.45□□□□□ -0.9
ZBED3-AS1-214ENST00000514640 MBD4O95243 580 aa9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms