RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 PXYLP1Q8TE99 480 aa20.13■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.13■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 COA7Q96BR5 231 aa20.13■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.13■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.13■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa20.12■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 ELNP15502 786 aa20.12■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 IRF5Q13568 498 aa20.12■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.12■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.12■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 PTPRFP10586 1907 aa20.12■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 BCAR3O75815 825 aa20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 SGPL1O95470 568 aa20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 BAG3O95817 575 aa20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 INHAP05111 366 aa20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 CAP2P40123 477 aa20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 MCAMP43121 646 aa20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 TREML2Q5T2D2 321 aa20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.11■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 USP17L5A8MUK1 530 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 PLCG2P16885 1265 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 TTC39AQ5SRH9 613 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 AS3MTQ9HBK9 375 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 TNNQ9UQP3 1299 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 CAPN2P17655 700 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 HMGCS2P54868 508 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 SNRKQ9NRH2 765 aa20.09■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 DEFB118Q96PH6 123 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 TRIM34Q9BYJ4 488 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 GPR108Q9NPR9 543 aa20.08■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP20.08■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 TNNI3KQ59H18 835 aa20.07■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.07■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.06■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 ASNSP08243 561 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 POLA2Q14181 598 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 EVI5O60447 810 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 PPP4CP60510 307 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 ATP8B2P98198 1209 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 WDR18Q9BV38 432 aa20.04■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 IGSF3O75054 1194 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 MTMR2Q13614 643 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 SSH3Q8TE77 659 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.03■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 C19orf81C9J6K1 198 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 HMGCRP04035 888 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 BACE1P56817 501 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.02■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 GINM1Q9NU53 330 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 PALD1Q9ULE6 856 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.02■□□□□ 0.8
ITGA3-211ENST00000508100 FLT1P17948 1338 aa20.02■□□□□ 0.79
ITGA3-211ENST00000508100 HLA-DOAP06340 250 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGA3-211ENST00000508100 ZAP70P43403 619 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGA3-211ENST00000508100 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGA3-211ENST00000508100 ADGRA1Q86SQ6 560 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGA3-211ENST00000508100 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGA3-211ENST00000508100 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.01■□□□□ 0.79
ITGA3-211ENST00000508100 USP17L10C9JJH3 530 aa20■□□□□ 0.79
ITGA3-211ENST00000508100 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ITGA3-211ENST00000508100 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
ITGA3-211ENST00000508100 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms