RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484986.1

PTPRN-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRN, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-215ENST00000484986 SSH3Q8TE77 659 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.16■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 GJB1P08034 283 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF280CQ8ND82 737 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 PI4KBQ9UBF8 816 aa27.15■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 FAM196BA6NMK8 535 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 CCL5P13501 91 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 DOCK1Q14185 1865 aa27.14■■□□□ 1.94
PTPRN-215ENST00000484986 CAP2P40123 477 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 GJA8P48165 433 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 SPP2Q13103 211 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 RNF208Q9H0X6 261 aa27.13■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 FLT3LGP49771 235 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 PPP4CP60510 307 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 AS3MTQ9HBK9 375 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 SNRKQ9NRH2 765 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 GABRQQ9UN88 632 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 USP17L5A8MUK1 530 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 ADCY3O60266 1144 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 IRF5Q13568 498 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 FAM110CQ1W6H9 321 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 TREML2Q5T2D2 321 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 PXYLP1Q8TE99 480 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 COA7Q96BR5 231 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 SHISA4Q96DD7 197 aa27.11■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 CAPN2P17655 700 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP27.1■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa27.1■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 ASNSP08243 561 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 HMGCS2P54868 508 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 HTATIP2Q9BUP3 242 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 TRIM34Q9BYJ4 488 aa27.08■■□□□ 1.93
PTPRN-215ENST00000484986 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 SH3D19Q5HYK7 790 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 WDR18Q9BV38 432 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 GINM1Q9NU53 330 aa27.07■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 PHIPQ8WWQ0 1821 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 H0YGN5 161 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 CERS3Q8IU89 383 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 DPF3Q92784 378 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 FLT1P17948 1338 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 PTPRFP10586 1907 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 INHAP05111 366 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 ZAP70P43403 619 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 UNC93B1Q9H1C4 597 aa27.05■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 ELNP15502 786 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 TMOD4Q9NZQ9 345 aa27.04■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 SGPL1O95470 568 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 HLA-DOAP06340 250 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 BACE1P56817 501 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 ADGRA1Q86SQ6 560 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.03■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 MGAMO43451 1857 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 C19orf81C9J6K1 198 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 MTMR2Q13614 643 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 ERC1Q8IUD2 1116 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 PALD1Q9ULE6 856 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 MAST2Q6P0Q8 1798 aa27.02■■□□□ 1.92
PTPRN-215ENST00000484986 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 RLBP1P12271 317 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 CYP7A1P22680 504 aa27.01■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 IDH1O75874 414 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 NR2E3Q9Y5X4 410 aa27■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 USP17L10C9JJH3 530 aa26.99■■□□□ 1.91
PTPRN-215ENST00000484986 TFRCP02786 760 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
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