RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471438.2

CSMD2-208, Transcript of CUB and Sushi multiple domains 2, human

TSL 5

Gene CSMD2, Length 355 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSMD2-208	ENST00000471438	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	EP400	Q96L91	3159 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TIAF1	O95411	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	SCNN1A	P37088	669 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	ARL4D	P49703	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	MLANA	Q16655	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	GATA6	Q92908	595 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	FUT4	P22083	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CTSW	P56202	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	BNIP3	Q12983	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM26D	Q5JW98	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	BCL11A	Q9H165	835 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	ATP10A	O60312	1499 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TNFRSF10B	O14763	440 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	DRD2	P14416	443 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CHD4	Q14839	1912 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	SHPRH	Q149N8	1683 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	KIF4A	O95239	1232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	INHBB	P09529	407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	HSPA6	P17066	643 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	NUDC	Q9Y266	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CSMD2-208	ENST00000471438	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	CD8B	P10966	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	ABTB2	Q8N961	1025 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	TTC16	Q8NEE8	873 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	STIM2	Q9P246	746 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	UNC13B	O14795	1591 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	USP47	Q96K76	1375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	PCSK2	P16519	638 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	ZAP70	P43403	619 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	PDE3B	Q13370	1112 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	MAP7	Q14244	749 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	RALBP1	Q15311	655 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	CEP120	Q8N960	986 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CSMD2-208	ENST00000471438	MROH2A	A6NES4	1674 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms