RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459667.1

VARS-218, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 3

Gene VARS, Length 793 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-218ENST00000459667 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 TBC1D8O95759 1140 aa25.07■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 CCL15Q16663 113 aa25.07■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.07■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.07■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 TNS4Q8IZW8 715 aa25.07■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.07■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 PICK1Q9NRD5 415 aa25.07■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.06■■□□□ 1.6
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VARS-218ENST00000459667 SMC5Q8IY18 1101 aa25.06■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 LCORLQ8N3X6 602 aa25.06■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.06■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.06■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 PTPN18Q99952 460 aa25.06■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.06■■□□□ 1.6
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VARS-218ENST00000459667 CFHR5Q9BXR6 569 aa25.05■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.05■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 MBD4O95243 580 aa25.04■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 PTPRAP18433 802 aa25.04■■□□□ 1.6
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VARS-218ENST00000459667 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 ARMT1Q9H993 441 aa25.04■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 ATAD5Q96QE3 1844 aa25.03■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.03■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.02■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 LNPKQ9C0E8 428 aa25.02■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 DNAJC18Q9H819 358 aa25.02■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.02■■□□□ 1.6
VARS-218ENST00000459667 CAP2P40123 477 aa25.01■■□□□ 1.59
VARS-218ENST00000459667 TTC6Q86TZ1 520 aa25.01■■□□□ 1.59
VARS-218ENST00000459667 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.01■■□□□ 1.59
VARS-218ENST00000459667 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.01■■□□□ 1.59
VARS-218ENST00000459667 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
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VARS-218ENST00000459667 FAM43AQ8N2R8 423 aa25■■□□□ 1.59
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VARS-218ENST00000459667 STAP2Q9UGK3 403 aa25■■□□□ 1.59
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VARS-218ENST00000459667 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
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VARS-218ENST00000459667 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.98■■□□□ 1.59
VARS-218ENST00000459667 FSD1Q9BTV5 496 aa24.98■■□□□ 1.59
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VARS-218ENST00000459667 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.98■■□□□ 1.59
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VARS-218ENST00000459667 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
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VARS-218ENST00000459667 PLCD1P51178 756 aa24.96■■□□□ 1.59
VARS-218ENST00000459667 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.96■■□□□ 1.59
VARS-218ENST00000459667 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.96■■□□□ 1.59
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VARS-218ENST00000459667 FKTNO75072 461 aa24.95■■□□□ 1.58
VARS-218ENST00000459667 GDF11O95390 407 aa24.95■■□□□ 1.58
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VARS-218ENST00000459667 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
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VARS-218ENST00000459667 USP17L5A8MUK1 530 aa24.94■■□□□ 1.58
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VARS-218ENST00000459667 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.93■■□□□ 1.58
VARS-218ENST00000459667 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
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VARS-218ENST00000459667 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
VARS-218ENST00000459667 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.93■■□□□ 1.58
VARS-218ENST00000459667 GINM1Q9NU53 330 aa24.93■■□□□ 1.58
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