RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 SERPINB13Q9UIV8 391 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.48■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 ANAPC4Q9UJX5 808 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 DLK2Q6UY11 383 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 NBPF3Q9H094 633 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 EHD4Q9H223 541 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 FSTL1Q12841 308 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 CHADLQ6NUI6 762 aa24.46■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.45■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 TRPM7Q96QT4 1865 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 FAM196BA6NMK8 535 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 SLURP2P0DP57 97 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 PDE4BQ07343 736 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 MIGA2Q7L4E1 593 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 RASEFQ8IZ41 740 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 HOOK2Q96ED9 719 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 CDCA5Q96FF9 252 aa24.44■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 GABPAQ06546 454 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 TOMM22Q9NS69 142 aa24.43■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 KCNB2Q92953 911 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 DNAJC18Q9H819 358 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 SWAP70Q9UH65 585 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 SNX14Q9Y5W7 946 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 E7EWF7 191 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 TRAF5O00463 557 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 PRDM1O75626 825 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 NF2P35240 595 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 CDK8P49336 464 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 DCAF15Q66K64 600 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 INCENPQ9NQS7 918 aa24.42■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 NEDD4P46934 1319 aa24.41■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D12O60347 775 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 TRDNQ13061 729 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 KRT32Q14532 448 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 TAOK2Q9UL54 1235 aa24.4■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 SHMT1P34896 483 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 ANAPC15P60006 121 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.39■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.5
HOXA4-202ENST00000428284 OTOFQ9HC10 1997 aa24.39■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 PRKG1Q13976 671 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 DOCK1Q14185 1865 aa24.38■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 ORC4O43929 436 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 FGRP09769 529 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 ADCK5Q3MIX3 580 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 NCOA7Q8NI08 942 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF341Q9BYN7 854 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 KRT23Q9C075 422 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 B4E1Z4 1266 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K10Q02779 954 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 FZD1Q9UP38 647 aa24.37■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 RASA1P20936 1047 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 ESR2Q92731 530 aa24.36■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
HOXA4-202ENST00000428284 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.35■■□□□ 1.49
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