RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 PPATQ06203 517 aa30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PPIL2Q13356 520 aa30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 CCL15Q16663 113 aa30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 SCYL3Q8IZE3 742 aa30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPN18Q99952 460 aa30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 PICK1Q9NRD5 415 aa30.21■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 MYH7P12883 1935 aa30.21■■■□□ 2.43
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HTATSF1-202ENST00000425695 MBD4O95243 580 aa30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
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HTATSF1-202ENST00000425695 BRI3BPQ8WY22 251 aa30.2■■■□□ 2.43
HTATSF1-202ENST00000425695 MYH1P12882 1939 aa30.2■■■□□ 2.42
HTATSF1-202ENST00000425695 SALL3Q9BXA9 1300 aa30.2■■■□□ 2.42
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HTATSF1-202ENST00000425695 UBE3CQ15386 1083 aa30.19■■■□□ 2.42
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HTATSF1-202ENST00000425695 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa30.18■■■□□ 2.42
HTATSF1-202ENST00000425695 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
HTATSF1-202ENST00000425695 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
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HTATSF1-202ENST00000425695 ZHX2Q9Y6X8 837 aa30.17■■■□□ 2.42
HTATSF1-202ENST00000425695 SIPA1L1O43166 1804 aa30.17■■■□□ 2.42
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HTATSF1-202ENST00000425695 CETPP11597 493 aa30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1-202ENST00000425695 PTPRAP18433 802 aa30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1-202ENST00000425695 PDE1AP54750 535 aa30.16■■■□□ 2.42
HTATSF1-202ENST00000425695 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
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HTATSF1-202ENST00000425695 STAP2Q9UGK3 403 aa30.15■■■□□ 2.42
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HTATSF1-202ENST00000425695 TTC6Q86TZ1 520 aa30.13■■■□□ 2.41
HTATSF1-202ENST00000425695 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
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HTATSF1-202ENST00000425695 OSBP2Q969R2 916 aa30.1■■■□□ 2.41
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HTATSF1-202ENST00000425695 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
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HTATSF1-202ENST00000425695 GADL1Q6ZQY3 521 aa30.05■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 EVI5LQ96CN4 794 aa30.05■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa30.05■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 FKTNO75072 461 aa30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 ASNSP08243 561 aa30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 DDRGK1Q96HY6 314 aa30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa30.03■■■□□ 2.4
HTATSF1-202ENST00000425695 USP17L12C9JPN9 530 aa30.03■■■□□ 2.4
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