RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421099.1

AC243428.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC243428.1, Length 264 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC243428.1-201ENST00000421099 LRRC14Q15048 493 aa4.89□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.89□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 LLGL2Q6P1M3 1020 aa4.89□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 FBF1Q8TES7 1133 aa4.89□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ELMO3Q96BJ8 720 aa4.89□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa4.89□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 MKNK2Q9HBH9 465 aa4.89□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 PCDHA4Q9UN74 947 aa4.89□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 LMNB1P20700 586 aa4.88□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 OXCT1P55809 520 aa4.88□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 IKZF1Q13422 519 aa4.88□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 DSC3Q14574 896 aa4.88□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.88□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 C12orf40Q86WS4 652 aa4.88□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 FAM168AQ92567 244 aa4.88□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 PRDM10Q9NQV6 1147 aa4.88□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 PPM1HQ9ULR3 514 aa4.88□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 SPG7Q9UQ90 795 aa4.88□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa4.87□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ENC1O14682 589 aa4.87□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 TRIM37O94972 964 aa4.87□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 KCT2Q8NC54 265 aa4.87□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.87□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.87□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ASB11Q8WXH4 323 aa4.87□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 U3KQE9 123 aa4.87□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 GIPC1O14908 333 aa4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 FANCGO15287 622 aa4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 PAGE1O75459 146 aa4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 TTLL10Q6ZVT0 673 aa4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 LRRN4CLQ8ND94 238 aa4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 SNX11Q9Y5W9 270 aa4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa4.86□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 BMP6P22004 513 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ZP2Q05996 745 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 PCNX4Q63HM2 1172 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 SLC23A3Q6PIS1 610 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 HDXQ7Z353 690 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ZNF507Q8TCN5 953 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 SETDB2Q96T68 719 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 SLC38A3Q99624 504 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 FOXQ1Q9C009 403 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 PRDM7Q9NQW5 492 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 CYP8B1Q9UNU6 501 aa4.85□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 CELA3AP09093 270 aa4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 USP17L7P0C7H9 530 aa4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ETF1P62495 437 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 MESP2Q0VG99 397 aa4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ARMCX6Q7L4S7 300 aa4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 ASB16Q96NS5 453 aa4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 C12orf49Q9H741 205 aa4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 FAM8A1Q9UBU6 413 aa4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 WWC3Q9ULE0 1092 aa4.84□□□□□ -1.63
AC243428.1-201ENST00000421099 CLCN7P51798 805 aa4.83□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 KCNMB1Q16558 191 aa4.83□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 UBE3DQ7Z6J8 389 aa4.83□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 SPACA3Q8IXA5 215 aa4.83□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.83□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 MIPEPQ99797 713 aa4.83□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 TNKS2Q9H2K2 1166 aa4.83□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 LRRC10BA6NIK2 292 aa4.82□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 LRIG2O94898 1065 aa4.82□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 LDHBP07195 334 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 KCNA1Q09470 495 aa4.82□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 CDKAL1Q5VV42 579 aa4.82□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 SCARA3Q6AZY7 606 aa4.82□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 ZSWIM9Q86XI8 627 aa4.82□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 PLPPR2Q96GM1 343 aa4.82□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa4.82□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 NTF4P34130 210 aa4.81□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 INPP5AQ14642 412 aa4.81□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.81□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 SFRP5Q5T4F7 317 aa4.81□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 RASIP1Q5U651 963 aa4.81□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
AC243428.1-201ENST00000421099 TTBK2Q6IQ55 1244 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms