RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TREML2Q5T2D2 321 aa16.27■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP45Q92619 1136 aa16.27■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEUROD6Q96NK8 337 aa16.27■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.19
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNMA3Q9UL41 463 aa16.27■□□□□ 0.19
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM110CQ1W6H9 321 aa16.26■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PI16Q6UXB8 463 aa16.26■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa16.26■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA5Q8NB90 893 aa16.26■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.25■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIPA1L1O43166 1804 aa16.25■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LDHCP07864 332 aa16.25■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GORABQ5T7V8 394 aa16.24■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa16.24■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.24■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D2Q9BYX2 928 aa16.24■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAI14Q9P0K7 980 aa16.24■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAOK2Q9UL54 1235 aa16.24■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NR2E3Q9Y5X4 410 aa16.24■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPN2P17655 700 aa16.23■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPP2Q13103 211 aa16.23■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB118Q96PH6 123 aa16.23■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRO3102Q9H379 93 aa16.23■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAP2P40123 477 aa16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCAMP43121 646 aa16.22■□□□□ 0.19
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX11Q8IYF3 940 aa16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FOCADQ5VW36 1801 aa16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALPK3Q96L96 1907 aa16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GNAI2P04899 355 aa16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM27P14373 513 aa16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AS3MTQ9HBK9 375 aa16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP17L5A8MUK1 530 aa16.21■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa16.21■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa16.21■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.21■□□□□ 0.19
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLXNB2O15031 1838 aa16.2■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EVI5O60447 810 aa16.2■□□□□ 0.18
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SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNNQ9UQP3 1299 aa16.2■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGCRP04035 888 aa16.19■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa16.19■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PI4KBQ9UBF8 816 aa16.19■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAMA3Q16787 3333 aa16.18■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PPC1 479 aa16.18■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAG3O95817 575 aa16.18■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASNSP08243 561 aa16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLCG2P16885 1265 aa16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTMR2Q13614 643 aa16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NECAB2Q7Z6G3 386 aa16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR18Q9BV38 432 aa16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAJC18Q9H819 358 aa16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR108Q9NPR9 543 aa16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MORF4L1Q9UBU8 362 aa16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GJD2Q9UKL4 321 aa16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FLT1P17948 1338 aa16.17■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BACE1P56817 501 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TNNI3KQ59H18 835 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKLE1Q8NAG6 615 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLUAP1Q96AJ1 413 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRKQ9NRH2 765 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCER2I3L3R5 266 aa16.16■□□□□ 0.18
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BCAR3O75815 825 aa16.16■□□□□ 0.18
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