RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417464.6

UPP1-205, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 782 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-205ENST00000417464 PICK1Q9NRD5 415 aa23.47■■□□□ 1.35
UPP1-205ENST00000417464 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
UPP1-205ENST00000417464 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.47■■□□□ 1.35
UPP1-205ENST00000417464 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-205ENST00000417464 CETPP11597 493 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-205ENST00000417464 USP5P45974 858 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-205ENST00000417464 JAG1P78504 1218 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-205ENST00000417464 LCORLQ8N3X6 602 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-205ENST00000417464 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.46■■□□□ 1.35
UPP1-205ENST00000417464 TBC1D12O60347 775 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 CAP1Q01518 475 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 MOGSQ13724 837 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 KCNH4Q9UQ05 1017 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 FOCADQ5VW36 1801 aa23.45■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 FKTNO75072 461 aa23.44■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.44■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 ARMT1Q9H993 441 aa23.44■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 DOCK1Q14185 1865 aa23.44■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 TRIM75PA6NK02 468 aa23.43■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 ADD2P35612 726 aa23.43■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.43■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.43■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 PRKAB2O43741 272 aa23.42■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 IGSF3O75054 1194 aa23.42■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 MBD4O95243 580 aa23.42■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 GDF11O95390 407 aa23.42■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.42■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 CAP2P40123 477 aa23.41■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.41■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 PDHXO00330 501 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 CYP2D6P10635 497 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 GPAT2Q6NUI2 795 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 GPATCH3Q96I76 525 aa23.4■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
UPP1-205ENST00000417464 PLCD1P51178 756 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa23.39■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.38■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 SMIM22K7EJ46 135 aa23.38■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 HLA-DOAP06340 250 aa23.38■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 NAV1Q8NEY1 1877 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 CXCL11O14625 94 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 IGHDP01880 384 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 CYP2C8P10632 490 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 SPP2Q13103 211 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 CERS3Q8IU89 383 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 CPA4Q9UI42 421 aa23.37■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 TRIM17Q9Y577 477 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.36■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 MYH1P12882 1939 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 MX1P20591 662 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 SP3Q02447 781 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 TREML2Q5T2D2 321 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.35■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 TLR2O60603 784 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 UBE3CQ15386 1083 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 LNPKQ9C0E8 428 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.34■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 USP17L5A8MUK1 530 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 GH2P01242 217 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 HMGCS2P54868 508 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 OSBP2Q969R2 916 aa23.33■■□□□ 1.33
UPP1-205ENST00000417464 GCC1Q96CN9 775 aa23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms