RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373459.4

VSTM2L-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2 like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene VSTM2L, Length 831 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2L-201ENST00000373459 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 CHGBP05060 677 aa28.23■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 USP5P45974 858 aa28.23■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 ABHD8Q96I13 439 aa28.23■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP28.23■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 SNAPC2Q13487 334 aa28.22■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa28.22■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 DOCK1Q14185 1865 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 CETPP11597 493 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 PTPRAP18433 802 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 PICK1Q9NRD5 415 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 KCNH4Q9UQ05 1017 aa28.21■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.2■■■□□ 2.11
VSTM2L-201ENST00000373459 GPR25O00155 361 aa28.2■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa28.2■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 FAM43AQ8N2R8 423 aa28.2■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 ZHX2Q9Y6X8 837 aa28.2■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 IGHDP01880 384 aa28.19■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 LCORLQ8N3X6 602 aa28.19■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 PI4K2BQ8TCG2 481 aa28.19■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 DNAJC18Q9H819 358 aa28.19■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 SALL3Q9BXA9 1300 aa28.18■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 PHIPQ8WWQ0 1821 aa28.18■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 CRHR2Q13324 411 aa28.18■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 UBE3CQ15386 1083 aa28.18■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 ARMT1Q9H993 441 aa28.18■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 MX1P20591 662 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 CAP2P40123 477 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 SMC5Q8IY18 1101 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 KBTBD3Q8NAB2 608 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 ATAD5Q96QE3 1844 aa28.17■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 BTBD19C9JJ37 291 aa28.16■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 CXCL11O14625 94 aa28.16■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 ERC2O15083 957 aa28.16■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 MBD4O95243 580 aa28.16■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 HLA-DOAP06340 250 aa28.16■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 MOGSQ13724 837 aa28.16■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa28.16■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 SDR42E1Q8WUS8 393 aa28.15■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 NAV1Q8NEY1 1877 aa28.14■■■□□ 2.1
VSTM2L-201ENST00000373459 PTPRFP10586 1907 aa28.14■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 PRKAB2O43741 272 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 FKTNO75072 461 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 PLCD1P51178 756 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 JAG1P78504 1218 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 DGKZQ13574 1117 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 TRIM34Q9BYJ4 488 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 MCOLN1Q9GZU1 580 aa28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 TTC6Q86TZ1 520 aa28.12■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 LNPKQ9C0E8 428 aa28.12■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 EHD4Q9H223 541 aa28.12■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 ANKRD23Q86SG2 305 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 MCM9Q9NXL9 1143 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 STAP2Q9UGK3 403 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 SERPINB13Q9UIV8 391 aa28.11■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 TRIM75PA6NK02 468 aa28.1■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 PDE1AP54750 535 aa28.1■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 EVX2Q03828 476 aa28.1■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 GPAT2Q6NUI2 795 aa28.1■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 CCDC85CA6NKD9 419 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 PDHXO00330 501 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 GDF11O95390 407 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 ASNSP08243 561 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 SPP2Q13103 211 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 TATDN1Q6P1N9 297 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 ZNF280CQ8ND82 737 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 OSBP2Q969R2 916 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2L-201ENST00000373459 USP17L5A8MUK1 530 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM2L-201ENST00000373459 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
VSTM2L-201ENST00000373459 NUCB1Q02818 461 aa28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms