RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 STAP2Q9UGK3 403 aa23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 SRGAP3O43295 1099 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTX1Q13505 466 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 MECOMQ03112 1051 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPP2Q13103 211 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.371e-6■■■□□ 16.3
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 DOCK2Q92608 1830 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 RHBDL3P58872 404 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 MGAMO43451 1857 aa23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 LAMA3Q16787 3333 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 A0A1B0GUL7 405 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 HMGCRP04035 888 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 XAGE2Q96GT9 111 aa23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM196BA6NMK8 535 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 DLL1O00548 723 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 LDHCP07864 332 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 RLBP1P12271 317 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 GSTO1P78417 241 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRCH3Q96II8 777 aa23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 MS4A1P11836 297 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 HMGCS2P54868 508 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPTORQ8N122 1335 aa23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP17L5A8MUK1 530 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 BMP8BP34820 402 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 CAP2P40123 477 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 TFCP2Q12800 502 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF384Q8TF68 577 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 NBPF3Q9H094 633 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 GJD2Q9UKL4 321 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 DOCK1Q14185 1865 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 GDF15Q99988 308 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL6A3P12111 3177 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 GORABQ5T7V8 394 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 SPATA5Q8NB90 893 aa23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 PANK1Q8TE04 598 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 RAI14Q9P0K7 980 aa23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 A0A0C4DFX4 3053 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPR153Q6NV75 609 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 TEX11Q8IYF3 940 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM32Q13049 653 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 PTPRFP10586 1907 aa23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC3-204ENST00000373166 PI16Q6UXB8 463 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 WDR18Q9BV38 432 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 CYP2B6P20813 491 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIB2Q92519 343 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASNSP08243 561 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 BACE1P56817 501 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP8B2P98198 1209 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 MTMR2Q13614 643 aa23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC3-204ENST00000373166 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms