RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 LY9Q9HBG7 655 aa21.69■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 RREB1Q92766 1687 aa21.69■■□□□ 1.06
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SH3BP1-201ENST00000357436 PFKFB1P16118 471 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT40Q6A162 431 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXW7Q969H0 707 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 NYXQ9GZU5 481 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 SMTNL1A8MU46 457 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
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SH3BP1-201ENST00000357436 TNNT1P13805 278 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 MICU3Q86XE3 530 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB43O43298 467 aa21.67■■□□□ 1.06
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SH3BP1-201ENST00000357436 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC10A5Q5PT55 438 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 PHKBQ93100 1093 aa21.67■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.67■■□□□ 1.06
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SH3BP1-201ENST00000357436 NLRP12P59046 1061 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 NBPF11Q86T75 865 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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SH3BP1-201ENST00000357436 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP6R2O75170 966 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 LIFRP42702 1097 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPAQ15257 358 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 SYCP1Q15431 976 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 PDCL2Q8N4E4 241 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 RTL9Q8NET4 1388 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC69A6NI79 296 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 SKILP12757 684 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 CCZ1BP86790 482 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 OLFM4Q6UX06 510 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 MAP3K14Q99558 947 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 ZSWIM5Q9P217 1185 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 HPSEQ9Y251 543 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 UBE4AQ14139 1066 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 GRIK5Q16478 980 aa21.64■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 NFXL1Q6ZNB6 911 aa21.64■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.06
SH3BP1-201ENST00000357436 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.64■■□□□ 1.05
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SH3BP1-201ENST00000357436 GOLGA8AA7E2F4 631 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 BIN1O00499 593 aa21.63■■□□□ 1.05
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SH3BP1-201ENST00000357436 MSL1Q68DK7 614 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 SHC4Q6S5L8 630 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 STK36Q9NRP7 1315 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 SERPINB2P05120 415 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 SYKP43405 635 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 TXNRD1Q16881 649 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 JMYQ8N9B5 988 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 KCND1Q9NSA2 647 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 PRDM4Q9UKN5 801 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 USP27XA6NNY8 438 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 DDR1Q08345 913 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.052e-15■■■□□ 14.9
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SH3BP1-201ENST00000357436 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
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SH3BP1-201ENST00000357436 SLC12A7Q9Y666 1083 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 NID2Q14112 1375 aa21.61■■□□□ 1.05
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SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.61■■□□□ 1.05
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SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM29Q14134 588 aa21.61■■□□□ 1.05
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SH3BP1-201ENST00000357436 RESP18Q5W5W9 173 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP135Q66GS9 1140 aa21.6■■□□□ 1.05
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