RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336576.9

DNAJB2-201, Transcript of DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene DNAJB2, Length 3,176 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB2-201ENST00000336576 H3BQV1 296 aa20.18■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 NPR1P16066 1061 aa20.18■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 CASQ1P31415 396 aa20.18■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 IFFO2Q5TF58 517 aa20.18■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 EFCC1Q9HA90 598 aa20.18■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.822e-9■■■■■ 46.9
DNAJB2-201ENST00000336576 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 XDHP47989 1333 aa20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 EVCP57679 992 aa20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 ANKRD65E5RJM6 399 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 NOP2P46087 812 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 PTPN21Q16825 1174 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 MUM1L1Q5H9M0 696 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 KLHL34Q8N239 644 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 IFNKQ9P0W0 207 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 LTBP1Q14766 1721 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 ARMCX5Q6P1M9 558 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 BRF1Q92994 677 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 MASTLQ96GX5 879 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.16■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 CCDC93Q567U6 631 aa20.15■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 GSDMDP57764 484 aa20.15■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 NBPF11Q86T75 865 aa20.15■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.15■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 KINO60870 393 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.14■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 CEP57L1Q8IYX8 460 aa20.14■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 OSBP2Q969R2 916 aa20.14■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.14■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 HELLSQ9NRZ9 838 aa20.14■□□□□ 0.82
DNAJB2-201ENST00000336576 DOCK2Q92608 1830 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 MYH7P12883 1935 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 TBC1D8O95759 1140 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 GOLGA8FQ08AF8 430 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 OLFM4Q6UX06 510 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 SP8Q8IXZ3 490 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 MAP4K1Q92918 833 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 BIN1O00499 593 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.14■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa20.13■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 DRC1Q96MC2 740 aa20.13■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa20.13■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 MAST3O60307 1309 aa20.13■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 M0R2C6 588 aa20.13■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 CHRNA5P30532 468 aa20.13■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 ALDH1B1P30837 517 aa20.13■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 SRLQ86TD4 932 aa20.13■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 GPATCH11Q8N954 259 aa20.13■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 POLLQ9UGP5 575 aa20.13■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 VPS37DQ86XT2 251 aa20.12■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 ANO10Q9NW15 660 aa20.12■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.12■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 IDH1O75874 414 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 CAVIN2O95810 425 aa20.12■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 ADD2P35612 726 aa20.12■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 TMC4Q7Z404 712 aa20.12■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 NECTIN1Q15223 517 aa20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 NRDCO43847 1150 aa20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 TADA3O75528 432 aa20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 SKIDA1Q1XH10 827 aa20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 ISM2Q6H9L7 571 aa20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 H0YIN7 160 aa20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 UFL1O94874 794 aa20.11■□□□□ 0.81
DNAJB2-201ENST00000336576 ICE2Q659A1 982 aa20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms