RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 CBX8Q9HC52 389 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 WASF1Q92558 559 aa26.53■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 EVX2Q03828 476 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 TRIM22Q8IYM9 498 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.52■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 MYH2Q9UKX2 1941 aa26.51■■□□□ 1.84
SNX18-201ENST00000326277 A0A1B0GVL5 298 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 SERPINB2P05120 415 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 CRY2Q49AN0 593 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 CCDC82Q8N4S0 544 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 TRIM37O94972 964 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 NDUFA8P51970 172 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.51■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 ST5P78524 1137 aa26.5■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 SLC39A14Q15043 492 aa26.5■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.5■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.5■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.5■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 GPSM2P81274 684 aa26.49■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 DEXIO95424 95 aa26.48■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 ZNF165P49910 485 aa26.48■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 IQCA1Q86XH1 822 aa26.48■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 MPNDQ8N594 471 aa26.48■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 MMP1P03956 469 aa26.48■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 CYP2D6P10635 497 aa26.48■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.48■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 ORC4O43929 436 aa26.47■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 MAP3K14Q99558 947 aa26.47■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.47■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.47■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 LAMB1P07942 1786 aa26.47■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 PPP2R5BQ15173 497 aa26.46■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 PTPAQ15257 358 aa26.46■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.46■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 CAVIN2O95810 425 aa26.46■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 SBK1Q52WX2 424 aa26.46■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 BTBD18B2RXH4 712 aa26.45■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 CMA1P23946 247 aa26.45■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 DDR1Q08345 913 aa26.45■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 GRIK5Q16478 980 aa26.45■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 STX1AQ16623 288 aa26.45■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 CATIPQ7Z7H3 387 aa26.45■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.45■■□□□ 1.83
SNX18-201ENST00000326277 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 SDF4Q9BRK5 362 aa26.45■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.44■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 PPP6R2O75170 966 aa26.44■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 UFL1O94874 794 aa26.44■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.44■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.44■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 IGSF3O75054 1194 aa26.43■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 PFKFB1P16118 471 aa26.43■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 TROAPQ12815 778 aa26.43■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.43■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.43■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 PROM2Q8N271 834 aa26.43■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 NMT2O60551 498 aa26.42■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 USP17L8P0C7I0 530 aa26.42■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 JMYQ8N9B5 988 aa26.42■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 A0A087WWV3 80 aa26.42■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 ZNF202O95125 648 aa26.42■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 ATP2B4P23634 1241 aa26.42■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 GSTO1P78417 241 aa26.42■■□□□ 1.82
SNX18-201ENST00000326277 FUT2Q10981 343 aa26.42■■□□□ 1.82
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