RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320238.3

NHLH2-201, Transcript of nescient helix-loop-helix 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NHLH2, Length 2,512 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2-201ENST00000320238 JAG2Q9Y219 1238 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 COL4A1P02462 1669 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 PRDM4Q9UKN5 801 aa22.16■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 FAM205CA6NFA0 338 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 FANCCQ00597 558 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF827Q17R98 1081 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 MYH3P11055 1940 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 SMTNL1A8MU46 457 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 CBX1P83916 185 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 FANCBQ8NB91 859 aa22.15■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 CTIFO43310 598 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 KLRK1P26718 216 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 PARP10Q53GL7 1025 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 USP49Q70CQ1 688 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 AK7Q96M32 723 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 CABP5Q9NP86 173 aa22.14■■□□□ 1.14
NHLH2-201ENST00000320238 TNKSO95271 1327 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 NEMFO60524 1076 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 SERPINC1P01008 464 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 BMP6P22004 513 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 PDE4BQ07343 736 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.14■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 FANCLQ9NW38 375 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 TUBE1Q9UJT0 475 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 GNAT2P19087 354 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 TPM4P67936 248 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 SHISA4Q96DD7 197 aa22.13■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 PRR29P0C7W0 189 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 CFAP100Q494V2 611 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 TMEM232C9JQI7 657 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 CUTAO60888 179 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 TIGD1Q96MW7 591 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 NHSL1Q5SYE7 1610 aa22.12■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 UBASH3AP57075 661 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 NPHP1O15259 732 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 GSDMDP57764 484 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 WASF1Q92558 559 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.11■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 MYL5Q02045 173 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF384Q8TF68 577 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 STK36Q9NRP7 1315 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 NMT2O60551 498 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 DEXIO95424 95 aa22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 OLFM4Q6UX06 510 aa22.09■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 SLC51AQ86UW1 340 aa22.09■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 ANKRD7Q92527 254 aa22.09■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.09■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 ESR2Q92731 530 aa22.09■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.09■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 LRP5O75197 1615 aa22.08■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 CASP1P29466 404 aa22.08■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.08■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.08■■□□□ 1.13
NHLH2-201ENST00000320238 WNT7AO00755 349 aa22.08■■□□□ 1.12
NHLH2-201ENST00000320238 CSRNP2Q9H175 543 aa22.08■■□□□ 1.12
NHLH2-201ENST00000320238 IKBKBO14920 756 aa22.07■■□□□ 1.12
NHLH2-201ENST00000320238 SEC23AQ15436 765 aa22.07■■□□□ 1.12
NHLH2-201ENST00000320238 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms