RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 DENND2AQ9ULE3 1009 aa9.82□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP2B6P20813 491 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS2P41220 211 aa9.81□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 RGS3P49796 1198 aa9.81□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 DOCK2Q92608 1830 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D12O60347 775 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 VAMP4O75379 141 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K10Q02779 954 aa9.8□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 SUCLG2Q96I99 432 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO3Q9UK99 471 aa9.8□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.8□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 COL6A3P12111 3177 aa9.79□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 WDR63Q8IWG1 891 aa9.79□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.79□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 DOCK1Q14185 1865 aa9.79□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 USP17L5A8MUK1 530 aa9.78□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 COL6A1P12109 1028 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 FGFR2P21802 821 aa9.78□□□□□ -0.84
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PGGT1B-201ENST00000296642 TREML2Q5T2D2 321 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 IL27Q8NEV9 243 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 APBA2Q99767 749 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 UTYO14607 1347 aa9.78□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMA3Q16787 3333 aa9.77□□□□□ -0.84
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf81C9J6K1 198 aa9.77□□□□□ -0.85
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PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF10AO00220 468 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 COL9A1P20849 921 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 GSTO1P78417 241 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP2B3Q16720 1220 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 GINM1Q9NU53 330 aa9.77□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCF2Q9UG63 623 aa9.77□□□□□ -0.85
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PGGT1B-201ENST00000296642 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPRFP10586 1907 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 DNM1LO00429 736 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ASNSP08243 561 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 CNGA1P29973 690 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM32Q13049 653 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHH3Q7Z736 793 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 LPAR1Q92633 364 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM122AQ96E09 287 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 GAKO14976 1311 aa9.76□□□□□ -0.85
PGGT1B-201ENST00000296642 DOCK3Q8IZD9 2030 aa9.75□□□□□ -0.85
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