RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269844.4

PRDM15-201, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM15, Length 4,881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-201ENST00000269844 IDH1O75874 414 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 DENND2CQ68D51 928 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 CTNND2Q9UQB3 1225 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 ENC1O14682 589 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 INF2Q27J81 1249 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 CCDC144BQ3MJ40 725 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 NCOA7Q8NI08 942 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 CTNNA2P26232 953 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 ATP8B2P98198 1209 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 FANCLQ9NW38 375 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 TPCN1Q9ULQ1 816 aa16.04■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 GGCXP38435 758 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 TNIP1Q15025 636 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 BMP15O95972 392 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 POTEJP0CG39 1038 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 MAGEA1P43355 309 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 SYNJ2O15056 1496 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 CAND2O75155 1236 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 RPS6KB1P23443 525 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 IFNAR2P48551 515 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 PACS2Q86VP3 889 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 FGD4Q96M96 766 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 CENPKQ9BS16 269 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 TSKSQ9UJT2 592 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 ZNF711Q9Y462 761 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 SBNO1A3KN83 1393 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 SEPT2Q15019 361 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 ARMCX6Q7L4S7 300 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 ATG3Q9NT62 314 aa16.03■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 TADA3O75528 432 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 CD248Q9HCU0 757 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 CABP1Q9NZU7 370 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 RALGAPBQ86X10 1494 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 ATP2A1O14983 1001 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 GUCY2DQ02846 1103 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 SCRN1Q12765 414 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.02■□□□□ 0.16
PRDM15-201ENST00000269844 PLA2G4AP47712 749 aa16.02■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 ALS2CLQ60I27 953 aa16.02■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 CEP70Q8NHQ1 597 aa16.02■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 IFT140Q96RY7 1462 aa16.02■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 CUL4AQ13619 759 aa16.02■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 THEGQ9P2T0 379 aa16.02■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 RGS12O14924 1447 aa16.02■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 SGSM2O43147 1006 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 MYL6BP14649 208 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 ME3Q16798 604 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 A0A087WWV3 80 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 JAK2O60674 1132 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 MYO1AQ9UBC5 1043 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 INSRP06213 1382 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 PAX7P23759 505 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 PLA2G4DQ86XP0 818 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 CFAP61Q8NHU2 1237 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 VAMP4O75379 141 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 TCP1P17987 556 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 ADALQ6DHV7 355 aa16.01■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 TRIM75PA6NK02 468 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 RNF8O76064 485 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 PNOCQ13519 176 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 LAMB3Q13751 1172 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 CHST3Q7LGC8 479 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 HVCN1Q96D96 273 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 KIF2CQ99661 725 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 MYO1FO00160 1098 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 CALML4Q96GE6 196 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 NAPBQ9H115 298 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 PTPN21Q16825 1174 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 HHATQ5VTY9 493 aa16■□□□□ 0.15
PRDM15-201ENST00000269844 SARM1Q6SZW1 724 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms