RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 TPM3P06753 285 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TM6SF1Q9BZW5 370 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 USP40Q9NVE5 1235 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CDCA5Q96FF9 252 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SMC3Q9UQE7 1217 aa30.87■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 F13A1P00488 732 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 FZD1Q9UP38 647 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CELF2O95319 508 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA6P17066 643 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP7A1P22680 504 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 RASA3Q14644 834 aa30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 APLP1P51693 650 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 RHBDL3P58872 404 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP3K12Q12852 859 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa30.85■■■□□ 2.53
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CAPNS1-201ENST00000246533 MIGA1Q8NAN2 632 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM39BQ9GZU3 492 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM13BQ9NYF5 915 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 CNTNAP1P78357 1384 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 AK2P54819 239 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 ZFPM1Q8IX07 1006 aa30.85■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 MAST2Q6P0Q8 1798 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 PDE6AP16499 860 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SYT1P21579 422 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTO1P78417 241 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TCP10Q12799 353 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS53Q5VIR6 699 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNB2Q92953 911 aa30.84■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPM7Q96QT4 1865 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 SLF2Q8IX21 1173 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 MYRIPQ8NFW9 859 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 PKNOX2Q96KN3 472 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 IL25Q9H293 177 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 GDPD2Q9HCC8 539 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM198AQ9UFP1 575 aa30.83■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 LDHCP07864 332 aa30.82■■■□□ 2.52
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CAPNS1-201ENST00000246533 RUFY3Q7L099 469 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
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CAPNS1-201ENST00000246533 TCHHQ07283 1943 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF532Q9HCE3 1301 aa30.82■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 MOB2Q70IA6 237 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TEPSINQ96N21 525 aa30.81■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 KDM4AO75164 1064 aa30.8■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ADCY5O95622 1261 aa30.79■■■□□ 2.52
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CAPNS1-201ENST00000246533 KBTBD3Q8NAB2 608 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SPTLC3Q9NUV7 552 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM88BA6NKF7 163 aa30.79■■■□□ 2.52
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CAPNS1-201ENST00000246533 PICALMQ13492 652 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa30.79■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 TMOD2Q9NZR1 351 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH7P12883 1935 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SSC5DA1L4H1 1573 aa30.78■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 SLURP2P0DP57 97 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 FUCA2Q9BTY2 467 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 USP25Q9UHP3 1055 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 HIP1O00291 1037 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa30.77■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 RFX7Q2KHR2 1363 aa30.76■■■□□ 2.52
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP4CP60510 307 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFAIP1Q13829 316 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 RASEFQ8IZ41 740 aa30.76■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa30.76■■■□□ 2.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa30.75■■■□□ 2.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FKBP1CQ5VVH2 108 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX11Q8IYF3 940 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 IDI2Q9BXS1 227 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 PDRG1Q9NUG6 133 aa30.75■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP30.74■■■□□ 2.51
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CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC171Q6TFL3 1326 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 BAG3O95817 575 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM83AQ86UY5 434 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa30.73■■■□□ 2.51
CAPNS1-201ENST00000246533 LCORLQ8N3X6 602 aa30.73■■■□□ 2.51
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