RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 NLRP10Q86W26 655 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 CARD6Q9BX69 1037 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 DACH1Q9UI36 760 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 PLA2G4AP47712 749 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 AIDAQ96BJ3 306 aa25.38■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 PHKA1P46020 1223 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 MORC3Q14149 939 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 TC2NQ8N9U0 490 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIML1Q8N9V2 468 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 BTBD18B2RXH4 712 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP8B1O43520 1251 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.37■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP3K9P80192 1104 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 RILPL1Q5EBL4 403 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC10Q8IXB1 793 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 CARD10Q9BWT7 1032 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 INCENPQ9NQS7 918 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 PRDM11Q9NQV5 511 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.658e-11■■□□□ 12.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPN21Q16825 1174 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.36■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 SPECC1Q5M775 1068 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.35■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 GUCY1A2P33402 732 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT23Q9C075 422 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 SERTAD1Q9UHV2 236 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC66A2RUB6 948 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 CASQ1P31415 396 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 GRIN1Q05586 938 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 HLFQ16534 295 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 SMARCE1Q969G3 411 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 NAPBQ9H115 298 aa25.34■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 PRR29P0C7W0 189 aa25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 AKNAD1Q5T1N1 836 aa25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA20Q8TB22 786 aa25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 FGFR2P21802 821 aa25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 KANK3Q6NY19 840 aa25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
HTATSF1-201ENST00000218364 TOM1O60784 492 aa25.33■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM22Q8IYM9 498 aa25.33■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 LPIN2Q92539 896 aa25.33■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 MED15Q96RN5 788 aa25.33■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR24Q96S15 920 aa25.33■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 MTA3Q9BTC8 594 aa25.33■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.33■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 STARD3NLO95772 234 aa25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 GNG11P61952 73 aa25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 GPTP24298 496 aa25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 NR1I3Q14994 352 aa25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 PDILTQ8N807 584 aa25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 KIFC2Q96AC6 838 aa25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.32■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 RTN1Q16799 776 aa25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 LRP5O75197 1615 aa25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 MBD4O95243 580 aa25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 DEXIO95424 95 aa25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 RCAN1P53805 252 aa25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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HTATSF1-201ENST00000218364 STAG1Q8WVM7 1258 aa25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 RAI14Q9P0K7 980 aa25.31■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP2C19P33261 490 aa25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 PLCD1P51178 756 aa25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 ADKP55263 362 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA5Q8NB90 893 aa25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 PDE8AO60658 829 aa25.3■■□□□ 1.64
HTATSF1-201ENST00000218364 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
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