RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105041.9

H2-Q1-202, Transcript of Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2-Q1, Length 1,954 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Camkk2Q8C078 588 aa13.71□□□□□ -0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Wdr19Q3UGF1 1341 aa13.71□□□□□ -0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dock5B2RY04 1868 aa13.71□□□□□ -0.21
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 D830030K20RikE9PYQ5 218 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm3043K7N693 218 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm16440K7N6G6 218 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm2244L7N2A3 218 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Vmn2r68L7N2B3 851 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm3278L7N2D2 218 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm8271L7N2E2 218 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Il7P10168 154 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Babam1Q3UI43 333 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nap1l3Q794H2 544 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pus7lQ8CE46 702 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Alg3Q8K2A8 438 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ndufv1Q91YT0 464 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Hdac9Q99N13 588 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sept14Q9DA97 430 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cnpy3Q9DAU1 276 aa13.71□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zfp646Q6NV66 1788 aa13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 TrdnE9Q9K5 693 aa13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nmt2O70311 529 aa13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mtx1P47802 317 aa13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tpm2P58774 284 aa13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sec23aQ01405 765 aa13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm2163Q6PCY5 473 aa13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mrps5Q99N87 432 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Znf287Q9EQB9 759 aa13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Trim44Q9QXA7 346 aa13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm20425E9Q035 978 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 SlkO54988 1233 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 En2P09066 324 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Myl3P09542 204 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kif4P33174 1231 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fdx1P46656 188 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 SrprbP47758 269 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cacnb3P54285 484 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Traf3ip1Q149C2 625 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ano1Q8BHY3 960 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 R3hcc1Q8BSI6 488 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cdk8Q8R3L8 464 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Terf2ipQ91VL8 393 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ly6iQ9WU67 134 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rgs12Q8CGE9 1381 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 UncxO08934 530 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rgs9O54828 675 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ftl1P29391 183 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Psmd1Q3TXS7 953 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Trim59Q922Y2 403 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rcan1Q9JHG6 198 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Clip2Q9Z0H8 1047 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa13.69□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Naaladl2A0A0N4SUJ3 795 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Stx8O88983 236 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Usp53P15975 1069 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rad23bP54728 416 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Foxp1P58462 705 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Npr3P70180 536 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Eya3P97480 510 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Map3k9Q3U1V8 1077 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc10a5Q5PT54 434 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ccdc178Q8CDV0 866 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rtn1Q8K0T0 780 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sirt2Q8VDQ8 389 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Yipf1Q91VU1 306 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Igbp1bQ9QZ29 343 aa13.68□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ltbp2O08999 1813 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm9992B2RWK3 458 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ube2hP62257 183 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ubxn2bQ0KL01 331 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ckap2Q3V1H1 664 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Unc93aQ710D3 458 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 KhnynQ80U38 671 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zbed3Q9D0L1 228 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cdc45Q9Z1X9 566 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cfap99A0A140LIX9 648 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Glt1d1A4FUP9 346 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc27a3O88561 667 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 LyarQ08288 388 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cnnm3Q32NY4 713 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tigd5Q499M4 642 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ccp110Q7TSH4 1004 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lrrc2Q8VDB8 371 aa13.67□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sall1Q9ER74 1322 aa13.66□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 A0A1W2P6Q8 802 aa13.66□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm9048A0A1W2P7H4 802 aa13.66□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 A0A1W2P7Z8 802 aa13.66□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm9046A0A1W2P855 802 aa13.66□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1700003F12RikA2AKE5 210 aa13.66□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Magea1O89006 320 aa13.66□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Magea5O89009 320 aa13.66□□□□□ -0.22
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 CgnP59242 1191 aa13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.8 ms