RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dctpp1Q9QY93 170 aa24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnh3Q9WVJ0 1095 aa24.22■■□□□ 1.47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dynll1P63168 89 aa24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Otop3Q80UF9 577 aa24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep89Q9CZX2 791 aa24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc39Q9D5Y1 937 aa24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif13bA0A286YCV9 1847 aa24.21■■□□□ 1.47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myo3bQ1EG27 1305 aa24.2■■□□□ 1.47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mapkapk5O54992 473 aa24.2■■□□□ 1.47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MsnP26041 577 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vnn1Q9Z0K8 512 aa24.2■■□□□ 1.47
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Heg1E9Q7X6 1337 aa24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Zscan20B2KFW1 1030 aa24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc27a1Q60714 646 aa24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp7b1Q60991 507 aa24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep120Q7TSG1 988 aa24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MlphQ91V27 590 aa24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MbipQ99LQ1 341 aa24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ltn1Q6A009 1767 aa24.2■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 EvplQ9D952 2035 aa24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp8b5A3FIN4 1183 aa24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ehmt1Q5DW34 1296 aa24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kif1bpQ6ZPU9 617 aa24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cfap69Q8BH53 942 aa24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf609Q8BZ47 1413 aa24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccdc94Q9D6J3 314 aa24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pnpla6Q3TRM4 1355 aa24.19■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tlr8P58682 1032 aa24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Anks1aP59672 1150 aa24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Usp13Q5BKP2 858 aa24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf653Q6YND2 615 aa24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Etnk1Q9D4V0 363 aa24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pla2g12bQ99P27 195 aa24.18■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubap1lG3UW59 384 aa24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Kcnd1Q03719 651 aa24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gpatch11Q3UFS4 262 aa24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubr3Q5U430 1889 aa24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Aknad1E9Q8N6 675 aa24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ms4a1P19437 291 aa24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nbr1P97432 988 aa24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pus7lQ8CE46 702 aa24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nek3Q9R0A5 511 aa24.17■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp3a25O09158 503 aa24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myo1bP46735 1107 aa24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GalcP54818 684 aa24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc7a1Q09143 622 aa24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Olfr119Q7TRJ5 321 aa24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smc2Q8CG48 1191 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krt23Q99PS0 422 aa24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Letm1Q9Z2I0 738 aa24.16■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Abl1P00520 1123 aa24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Grin1P35438 938 aa24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam89aQ14BJ1 175 aa24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Clec16aQ80U30 1036 aa24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 QarsQ8BML9 775 aa24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc14a2Q8R4T9 930 aa24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hic2Q9JLZ6 619 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sh3tc1G3X9F6 1346 aa24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nxf2Q4ZGD8 691 aa24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa24.15■■□□□ 1.46
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prr16A3KMN5 304 aa24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Calm1P0DP26 149 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TbcaP48428 108 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5592Q3V0A6 857 aa24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp12aQ9Z1W8 1035 aa24.14■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slurp2P0DP59 97 aa24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam83bQ0VBM2 1012 aa24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tfcp2Q9ERA0 502 aa24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tob2Q9JM55 345 aa24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SsbP32067 415 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ankrd13dQ6PD24 605 aa24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Adgra3Q7TT36 1310 aa24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Snapc4Q8BP86 1333 aa24.13■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Slc1a4O35874 532 aa24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Luc7l2Q7TNC4 392 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sass6Q80UK7 654 aa24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col11a2Q64739 1736 aa24.12■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prss40A6H6T1 365 aa24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acad12D3Z7X0 555 aa24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Traf3ip1Q149C2 625 aa24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cyp4x1Q6A152 507 aa24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ubac1Q8VDI7 409 aa24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dydc2Q9D3X8 139 aa24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pet2A2AHY8 747 aa24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LtkP08923 888 aa24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbm26Q6NZN0 1012 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cep135Q6P5D4 1140 aa24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30 ms