RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639848.1

HLA-B-256, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, human

BASIC

Gene HLA-B, Length 1,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HLA-B-256	ENST00000639848	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
HLA-B-256	ENST00000639848	MT1L	Q93083	61 aa		7.2	□□□□□ -1.26
HLA-B-256	ENST00000639848	PSPHP1	O15172	72 aa		7.18	□□□□□ -1.26
HLA-B-256	ENST00000639848		K7ERS5	55 aa		7.16	□□□□□ -1.26
HLA-B-256	ENST00000639848	MT1M	Q8N339	61 aa		7.14	□□□□□ -1.27
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		7.09	□□□□□ -1.27
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP12-3	P60328	96 aa		7.05	□□□□□ -1.28
HLA-B-256	ENST00000639848	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	7.04	□□□□□ -1.28
HLA-B-256	ENST00000639848		A6NED7	52 aa		6.97	□□□□□ -1.29
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.92	□□□□□ -1.3
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.9	□□□□□ -1.3
HLA-B-256	ENST00000639848	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.87	□□□□□ -1.31
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.86	□□□□□ -1.31
HLA-B-256	ENST00000639848	PRO0628	Q9UI54	55 aa		6.85	□□□□□ -1.31
HLA-B-256	ENST00000639848	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.8	□□□□□ -1.32
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.8	□□□□□ -1.32
HLA-B-256	ENST00000639848	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.78	□□□□□ -1.32
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.77	□□□□□ -1.33
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.76	□□□□□ -1.33
HLA-B-256	ENST00000639848	MT4	P47944	62 aa		6.71	□□□□□ -1.34
HLA-B-256	ENST00000639848	ROMO1	P60602	79 aa		6.68	□□□□□ -1.34
HLA-B-256	ENST00000639848	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.67	□□□□□ -1.34
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.64	□□□□□ -1.35
HLA-B-256	ENST00000639848	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.55	□□□□□ -1.36
HLA-B-256	ENST00000639848	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.51	□□□□□ -1.37
HLA-B-256	ENST00000639848	PMAIP1	Q13794	54 aa		6.47	□□□□□ -1.37
HLA-B-256	ENST00000639848	BRK1	Q8WUW1	75 aa		6.46	□□□□□ -1.38
HLA-B-256	ENST00000639848	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.44	□□□□□ -1.38
HLA-B-256	ENST00000639848	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.38	□□□□□ -1.39
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.37	□□□□□ -1.39
HLA-B-256	ENST00000639848	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.37	□□□□□ -1.39
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.36	□□□□□ -1.39
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.26	□□□□□ -1.41
HLA-B-256	ENST00000639848	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HLA-B-256	ENST00000639848	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.17	□□□□□ -1.42
HLA-B-256	ENST00000639848	MT1A	P04731	61 aa		6.15	□□□□□ -1.42
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.11	□□□□□ -1.43
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.07	□□□□□ -1.44
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.02	□□□□□ -1.45
HLA-B-256	ENST00000639848		H3BS24	57 aa		5.98	□□□□□ -1.45
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.95	□□□□□ -1.46
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.92	□□□□□ -1.46
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.78	□□□□□ -1.48
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.77	□□□□□ -1.49
HLA-B-256	ENST00000639848	MT3	P25713	68 aa		5.63	□□□□□ -1.51
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.57	□□□□□ -1.52
HLA-B-256	ENST00000639848	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.54	□□□□□ -1.52
HLA-B-256	ENST00000639848	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.53	□□□□□ -1.52
HLA-B-256	ENST00000639848		A0A0A0MQY5	61 aa		5.35	□□□□□ -1.55
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.3	□□□□□ -1.56
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.27	□□□□□ -1.57
HLA-B-256	ENST00000639848	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
HLA-B-256	ENST00000639848	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.2	□□□□□ -1.58
HLA-B-256	ENST00000639848	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
HLA-B-256	ENST00000639848	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.16	□□□□□ -1.58
HLA-B-256	ENST00000639848	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HLA-B-256	ENST00000639848	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HLA-B-256	ENST00000639848	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HLA-B-256	ENST00000639848	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
HLA-B-256	ENST00000639848	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.73	□□□□□ -1.65
HLA-B-256	ENST00000639848	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.46	□□□□□ -1.7
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.32	□□□□□ -1.72
HLA-B-256	ENST00000639848	INE1	O15225	51 aa		4.29	□□□□□ -1.72
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.27	□□□□□ -1.73
HLA-B-256	ENST00000639848	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.19	□□□□□ -1.74
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.02	□□□□□ -1.77
HLA-B-256	ENST00000639848	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.72	□□□□□ -1.81
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.6	□□□□□ -1.83
HLA-B-256	ENST00000639848	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.41	□□□□□ -1.86
HLA-B-256	ENST00000639848	PRM1	P04553	51 aa		3.39	□□□□□ -1.87
HLA-B-256	ENST00000639848	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.78	□□□□□ -1.96
HLA-B-256	ENST00000639848	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.37	□□□□□ -2.03

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